本书编选了2006年中国科学院“智能计算与生物信息学”学术研讨会的40篇论文。内容涉及智能计算与生物信息学各主要领域，包括蛋白质结构与相互作用(9篇)、基因测定与算法设计(12篇)、序列分析与结构比对(3篇)、生物数据库的开发、管理与搜索策略(4篇)、智能计算在生物信息学领域的应用研究(8篇)及其他(4篇)等。这些论文反映了近几年国内和国外智能计算与生物信息学领域的部分最新研究成果，基本代表了目前智能计算与生物信息学技术的发展状况，具有较高的学术价值。本书适合相关领域的科技人员和大专院校师生参考。

本书编选了2006年中国科学院“智能计算与生物信息学”学术研讨会的40篇论文。内容涉及智能计算与生物信息学各主要领域，包括蛋白质结构与相互作用(9篇)、基因测定与算法设计(12篇)、序列分析与结构比对(3篇)、生物数据库的开发、管理与搜索策略(4篇)、智能计算在生物信息学领域的应用研究(8篇)及其他(4篇)等。

本书反映了近几年国内和国外智能计算与生物信息学领域的部分最新研究成果，基本代表了目前智能计算与生物信息学技术的发展状况，具有较高的学术价值。

第一部分 蛋白质结构与相互作用

Structural Modelling of the Saccharomyces Cerevisiae and Candida Albicans PEPCKs：Models

 for the Antifungal Drug Design

计算机模拟短小芽孢杆菌木聚糖酶与底物木聚糖的对接

数据挖掘在蛋白质二级结构建模中的应用研究

一种基于最小自由能和协变信息预测带伪结RNA二级结构的迭代化方法

Effective Protein Folding Prediction Based on Genetic-Annealing Algorithm in Toy Model

3D Structural Motif Finding in Protein Strutures by Network Alignment

RelBay：A Combined Method for Mining Literature of Protein Phosphorylation Sites

Prediction of Enzyme Catalytic Residues Based on Naive Bayes Classification

蛋白质折叠速率计算

第二部分 基因测定与算法设计

Mining Data of Global Gene Expression in Human Skeletal Muscle Relate to Regular

 Aerobic Exercise by BRB-ArrayToolsKe Jiebing，Ma Wenli，Lin Jiandi，Jiang Li，Zheng Wenling

酵母基因上游中二聚体寡核苷酸转录调控位点的分析

基于基因表达谱的肿瘤分类研究进展

基于大规模DNA微阵列数据的调控亚网络的重建

基于模糊关联规则的聚类算法在基因表达数据分析中的研究

基于序列特征的戊肝病毒基因分型方法

细菌基因组水平转移基因预测

Quantitative Analysis of Gene Regulatory Networks in Response to V~ous Environmental Stresses

调控元件和组合元件的识别以及全基因组分布分析

Hybrid Intelligent Data Mining Techniques and Array CGH in Breast Cancer Profiling

Hlippo Menolascina，Stefania Tommasi，Vita Fedele，Angelo Paradiso，Giuseppe Mastronardi，Vitoantonio Bevilacqua

基于基因芯片表达谱的癌症预后元分析研究

针对早期应答基因的专用检测芯片设计

第三部分 序列分析与结构比对

一种快速的序列次序无关的结构比对方法

ANew Method for Pairwise Protein Structure Alignment

Genome—wide Comparative Phylogenetic Analysis of SBP—box Gene Family in Arabidopsis and Rice

第四部分 生物数据库的开发、管理与搜索策略

生物序列数据库管理系统研究

基于Web的基因表达数据管理系统的设计与实现

疾病相关SNP数据的分类组织及数据库构建

MoBIoS Index：Support Distance-Based Queries in Bioinformatics

第五部分 智能计算在生物信息学领域的应用研究

SAT问题的主要算法模型

拟位生物信息学分析工具

ANew Method for Conversion from Torsion Space to Cartesian Space

Thirty-four Pseudoknots of Twenty-two Human C2H2 Zinc Finger ESTs Discovered

 by Computational Structural Analysis

An Adaptive Elastic Registration of Two-Dimensional Electrophoresis Gel Images

 Using Intensity Information and Landmark Points

具有灾变效应的合作式协同进化遗传算法

Data Model of Knowledge Base of Reproductive Biology

Effect of Decay Functions in Medical Diagnoses with GRLS Neural Networks

第六部分 其他

Bc1，2家族蛋白调控线粒体外膜通透性的细胞自动机模拟

The Relationship Between Molecular Motions of HIV-1 gpl20 Mutants and Their Preferences

 for Different Conformations

Neighboring Nucleotide Biases of the Intra-Varietal Single Nucleotide Polymorphisms

of the rice Plastid Genome

基于MATLAB的分子系统学研究——以鳄类分子系统学研究为例