本文集包含十一卷，卷首为圣主躬耕藉赋，包括圣主亲诣太学颂、青海平定诗序、日月合璧、五星联珠颂、清河颂共5篇。卷一至四为序文62篇；卷五为记14篇；卷六为传12篇；卷七、八为论、说、书30篇；卷九为墓表、志铭、行状14篇；卷十为祝文、祭文16篇；卷十一为杂著18篇。
本次整理，以清雍正十年（一七三二）刻本《二希堂文集》爲点校底本，以《四库全书》本，明正德八年（一五一三）万历元年（一五七三）万历四十一年（一六一三）《漳州府志》及清康熙五十四年（一七一五）光绪三年（一八七七）《漳州府志》为主要参校本。

前言
点校凡例
二希堂文集序
皇四子序
皇五子序
序
编校姓氏
二希堂文集卷之首
圣主躬耕耤田赋
圣主亲诣大学颂
青海平定诗序
日月合壁五星联珠颂
河清颂
二希堂文集卷一
乐善堂文钞序
稽古斋文钞序
历代名儒名臣循吏传总序
历代名儒传序
历代名臣传序
历代循吏传序
四书朱子全义序
……
二希堂文集卷二
二希堂文集卷三
二希堂文集卷四
二希堂文集卷五
二希堂文集卷六
二希堂文集卷七
二希堂文集卷八
二希堂文集卷九
二希堂文集卷十
二希堂文集卷十一