《清静经》以“清静”二字为全经之主轴。清静与浊动相反，清静契道，浊动应物；清属阳，却由静而生；静属阴，却以浊为根。此经在哲理上，是沿承《老子》、《文子》、《庄子》等道家“道”、“物”说之理论而来。道为本体，物为现象；本体永常不变；现象有相有用，而有生灭终始。经中说明现象间万物之阴阳、清浊、动静等关系，以及人如何由物而返道的修炼方式。《清静经》是汇聚道家思想精髓而成的经典，解释宇宙万象的由来生化，以及变化的原理原则，是中土思想精华所在。
萧登福编著的《太上老君说常清静妙经通解》认为《道德经》、《清静经》、《感应篇》三者，是道教最重要、最基本的经典，此三经皆标榜太上老君所说或所作，可以名为太上三经。这三经中，《道德经》为道家道教的根本大典，有人事、有天道，可以谈哲学，可以论宗教。《感应篇》以积善去恶为说，有宋儒“存诚主敬”的为人处世态度，而较偏向于“存神主敬”，其说类似佛教的说“有”。《清静经》论述动静一体，善恶相对待，有无同出一源，以无为清静为宗，则类似佛教的谈“空”。