由于我国幅员辽阔，河湖众多，各流域甚至各支流的生态环境条件都有着很大的差异，借鉴水专项提出的“一河一策”“一湖一策”的指导思想，本书提出流域水生态环境质量评价也要“因河制宜”“因湖制宜”，即流域水生态环境质量监测与评价作为一个开放的体系，将适用于我国流域的监测与评价方法都纳入进来，各地在水生态监测实践当中，可以按照本书建议的模式，从中筛选出适合本地流域特点的监测与评价方法，并在长期监测中不断摸索，修正完善，使之更适合本地流域水生态质量监测与评价的需要。
本书为环境保护、水利等相关部门的工作人员进行水生态监测时提供技术辅助，同时也为大专院校等开展相关研究工作提供参考。

篇 科学基础
章 人类活动对流域生态环境的威胁日益严重
第二章 生态监测／评价是指示流域生态环境的有效工具
第三章 常用的生态监测／评价方法
节 指示生物法
第二节 多样性指数
第三节 生物指数
第四节 多参数法
第五节 多变量法
第六节 功能性方法
第七节 综合评价法
第四章 国外水生态监测／评价体系
节 河流生态监测／评价体系
第二节 湖库生态监测／评价体系
第五章 国内流域生态监测／评价现状
第二篇 河流水生态环境质量监测与评价
第六章 背景调查和点位布设
节 监测点位的布设原则
第二节 背景调查
第三节 监测点位的布设方法
第四节 采样频率和时间
第七章 样品采集与结果评价
节 大型底栖动物
附录A
第二节 浮游植物和着生藻类
附录B
第三节 浮游动物
附录C
第八章 质量控制和质量保证
节 人员资质
第二节 基本概念
第三节 监测点位的布设
第四节 生境调查中的质量控制和质量保证
第五节 采样及保存中的质量控制和质量保证
第六节 鉴定中的质量控制和质量保证
第九章 河流水生态环境质量综合评价与报告编写
节 河流水生态环境质量综合评价
第二节 河流水生态环境质量监测与评价报告编写模板
第三篇 湖库水生态环壤质量监测与评价
第十章 背景调查和点位布设
节 湖库背景调查
第二节 湖库监测点位布设原则
第三节 湖库监测点位布设方法
第四节 监测频率和时间
第十一章 湖库水生态质量监测方法
节 生境调查
第二节 大型底栖动物
第三节 浮游植物
第四节 浮游动物
附录D
第十二章 湖库水生态环境质量评价方法
节 水质评价
第二节 生境评价
第三节 生物评价
第四节 水生态环境质量综合评价
附录E
第十三章 质量控制和质量保证
节 采样及保存中的质量控制和质量保证
第二节 鉴定中的质量控制和质量保证
第三节 结果评价中的质量控制和质量保证
第四节 人员资质
第十四章 水生态监测报告编写
节 编写要求
第二节 编写模板