吴敦序主编的《中医基础理论(供中医类专业用普通高等教育中医药类规划教材)》是在1983年出版的《中医基础理论》教材基础上，吸收十年来中医基础理论研究的进展和部份中医教师，包括中医基础理论教师的意见，经过反复研究，编写而成的。
中医基础理论的主要内容包括四个部份。即中医学的哲学基础、中医学对正常人体的认识、中医学对疾病的认识、以及中医养生和治疗疾病的原则。本教材中，将分别予以详细论述。

绪论
第一章 中医学的哲学基础和主要思维方法
第一节 精气学说
第二节 阴阳学说
第三节 五行学说
第四节 中医学的主要思维方法
第二章 气血津液
第一节 气
第二节 血
第三节 津液
第四节 气血津液的关系
第三章 脏腑
第一节 五脏
第二节 六腑
第三节 奇恒之府
第四节 脏腑之间的关系
第四章 经络
第一节 经络的概念和经络系统
第二节 经络的基本生理功能
第三节 十二经脉
第四节 奇经八脉
第五节 经别、别络、经筋、皮部
第五章 形体和官窍
第一节 形体
第二节 官窍
第六章 病因
第一节 外感病因
第二节 内伤病因
第三节 病理产物形成的病因
第四节 其他病因
第七章 发病
第一节 发病原理
第二节 发病类型
第八章 病机
第一节 基本病机
第二节 疾病传变
第九章 养生与治则
第一节 养生
第二节 治则