前言
上篇
第一章 绪论
第一节 本草基因组学的产生和发展
第二节 本草基因组学研究内容
第三节 本草基因组学的应用
参考文献
第二章 结构基因组学研究策略
第一节 核基因组研究策略
第二节 叶绿体基因组研究策略
第三节 线粒体基因组研究策略
参考文献
第三章 药用生物核基因组
第一节 人参基因组
第二节 灵芝基因组
第三节 丹参基因组
第四节 长春花基因组
第五节 铁皮石斛基因组
参考文献
第四章 药用生物细胞器基因组
第一节 药用植物叶绿体基因组
第二节 药用生物线粒体基因组
参考文献
第五章 功能基因组学——药用生物转录组研究
第一节 转录组研究策略
第二节 药用植物转录组
第三节 药用动物转录组
第四节 药用真菌转录组
参考文献
第六章 功能基因组学——药用生物蛋白质组研究
第一节 药用植物蛋白质组
第二节 药用动物蛋白质组
参考文献
第七章 功能基因组学——药用植物代谢组研究
第一节 药用植物代谢组研究策略
第二节 基于代谢组学的中药鉴定和质量评价
第三节 基于代谢组学的天然产物合成研究
参考文献
第八章 功能基因组学——天然产物生物合成途径解析
第一节 天然产物生物合成途径研究策略
第二节 萜类生物合成途径
第三节 生物碱类生物合成途径
第四节 黄酮类生物合成途径
参考文献
第九章 表观基因组学
第一节 表观基因组研究策略
第二节 非编?
第三节 DNA甲基化
参考文献
第十章 药用生物宏基因组学
第一节 药用生物宏基因组学研究策略
第二节 药用植物根际微生物宏基因组
第三节 药用植物内生菌宏基因组
参考文献
下篇
第十一章 药用模式生物研究
第一节 药用模式生物研究策略
第二节 药用模式真菌——灵芝
第三节 药用模式植物——丹参
参考文献
第十二章 中药合成生物学研究
第一节 中药合成生物学体系创建
第二节 中药合成生物学体系优化策略
第三节 萜类合成生物学
第四节 生物碱合成生物学
第五节 黄酮合成生物学
参考文献
第十三章 药用植物分子育种研究
第一节 药用植物分子育种原理与方法
第二节 优质高产药用植物分子育种
第三节 抗逆药用植物分子育种
参考文献
第十四章 中药分子鉴定
第一节 DNA条形码鉴定
第二节 超级条形码鉴定
第三节 其他分子鉴定技术
参考文献
第十五章 药物体内过程组学研究
第一节 中药药物基因组学
第二节 中药肠道宏基因组学
第三节 中药药物蛋白质组学
第四节 中药药物代谢组学
参考文献
第十六章 本草基因组学关键实验技术
第一节 结构基因组学关键技术
第二节 基因功能研究关键技术
第三节 蛋白质组学关键技术
第四节 代谢组学关键技术
第五节 合成生物学关键技术
参考文献
第十七章 生物信息学及数据库
第一节 生物信息学编程基础
第二节 生物信息学常用分析方法
第三节 基因组相关数据库
参考文献
核心参考文献
主要名词中英文对照表

本草基因组学是从组学水平研究中药及其与人体相互作用的一门新兴学科。陈士林主编的《本草基因组学(供中药学药用植物学中药资源学中药鉴定学等专业使用全国高等医药院校规划教材)》在前版《本草基因组学》专著的基础上，对近十年来本草基因组学研究进行了细致的梳理和总结，并对学科发展与未来的研究思路和方向进行了探讨，为传统中药与现代生命科学的结合提供了学科支撑。本书上篇包括绪论、结构基因组学、功能基因组学、表观基因组学和宏基因组学等，下篇包括药用模式生物、中药合成生物学、基因组辅助育种、中药分子鉴定、中药体内过程组学研究、关键实验技术和生物信息学及数据库等内容。
本书适用于高等院校中医药相关专业本科和研究生课程使用，也可作为教师的教学和科研参考书。