《妖怪学讲义录》是日本著名佛教哲学家井上圆了在哲学馆教授的讲义，发行后销路看好，曾多次再版，“甚见重于其国人，甚有益于其民俗”。迷信是一种文化的产物．几千年的历史繁衍了成千上万的虔迷者，而要破除这些违反科学的信仰和信念，只有通过科学与哲学。蔡元培试图通过译述《妖怪学讲义录（总论迷信与文化四书）》以振兴教育启蒙和推进社会道德，他指出反对迷信、建立健全的道德不可无健全的知识，“欲为国家拂拭迷云妄雾，必兼开智德二光”，必须“祛人心之迷妄”，普及科学知识。《妖怪学讲义录》被列入“影响中国近代社会的一百种译作”，可见此书对近代中国影响之大。

卷之一上

第一讲 定义篇

 第一节 开讲 

 第二节 妖怪与不思议之异同

 第三节 妖怪与异常变态之关系

 第四节 妖怪之标准

 第五节 假怪与真怪之别

 第六节 迷误之原因

第二讲 学科篇

 第七节 妖怪学之所以未设学科

 第八节 学问全体之学科表

 第九节 妖怪学所以为应用学

 第十节 心性与妖怪之关系

 第十一节 妖怪学与心理学之关系

 第十二节 妖怪学与诸学之关系

 第十三节 第二分类法

 第十四节 第二分类表

 第十五节 第三分类法

 第十六节 学科分类之归结

第三讲 关系篇

 第十七节 实际上之关系

 第十八节 与宗教之关系

 第十九节 与教育之关系

 第二十节 与政治之关系

 第二十一节 与医术之关系

 第二十二节 与实业之关系

 第二十三节 与风俗之关系

第四讲 种类篇

 第二十四节 妖怪之分类

 第二十五节 物理的妖怪之种类

 第二十六节 心理的妖怪之种类

 第二十七节 心理学上之分类

 第二十八节 诸学上之妖怪

 第二十九节 理学的及哲学的妖怪

 第三十节 真正之妖怪

第五讲 历史篇

 第三十一节 妖怪学之历史

 第三十二节 太古之时代

 第三十三节 发达之时期

 第三十四节 第一时期

 第三十五节 第二时期

 第三十六节 第三时期

 第三十七节 理外的说明法

 第三十八节 惟心的说明法

 第三十九节 经验的说明法

 第四十节 说明法之归结

 第四十一节 妖怪事项之起原及发达

 第四十二节 妖怪历史之分类

第六讲 原因篇

 第四十三节 迷误之原因

 第四十四节 妖怪谈话之真伪

 第四十五节 知识与妖怪之关系

 第四十六节 妖怪与论理之关系

 第四十七节 演绎的妖怪

 第四十八节 归纳的妖怪

 第四十九节 因果与妖怪之关系

 第五十节 事实考定法

 第五十一节 妖怪体之大分类

卷之一中

第七讲 说明篇第一

 第五十二节 心理学上之说明

 第五十三节 物心相关之说明

 第五十四节 身心相关之说明

 第五十五节 神经系统

 第五十六节 感觉及知觉

 第五十七节 再想及构想

 第五十八节 虚想

 第五十九节 感情及意志

第八讲 说明篇第二

 第六十节 意识论第一（定义）

 第六十一节 意识论第二（意识、 无意识之区别）

 第六十二节 意识论第三（心力与意识之关系）

 第六十三节 意识论第四（意识之范围）

 第六十四节 意识论第五（意识与观念之关系）

 第六十五节 意识论第六（意识与社会之比较）

 第六十六节 注意论第一（注意之义解及性质）

 第六十七节 注意论第二（注意与意识之关系）

第九讲 说明篇第三

 第六十八节 习惯论第一

 第六十九节 习惯论第二

 第七十节 联想论第一

 第七十一节 联想论第二

 第七十二节 信仰论第一

 第七十三节 信仰论第二

 第七十四节 惊情论第一

 第七十五节 惊情论第二

 第七十六节 恐怖论第一

 第七十七节 恐怖论第二

 第七十八节 复情论第一

 第七十九节 复情论第二

 第八十节 复情论第三

 第八十一节 想象论第一

 第八十二节 想象论第二

 第八十三节 愿望论第一

 第八十四节 愿望论第二

 第八十五节 意志论第一

 第八十六节 意志论第二

 第八十七节 意志论第三

 第八十八节 情意论归结

卷之一下

第十讲 说明篇 第四变式的心理学 第一总论

 第八十九节 妖怪的现象

 第九十节 变态之起原

 第九十一节 妖怪之要素

 第九十二节 外界之要素

 第九十三节 中间之要素第一

 第九十四节 中间之要素第二

 第九十五节 内界之要素第一

 第九十六节 内界之要素第二

 第九十七节 情意之异状

 第九十八节 妖怪要素之全表

第十一讲 说明篇 第五变式的心理学各论

 第九十九节 感觉论顺序

 第百节 视觉之异象第一

 第百一节 视觉之异象第二

 第百二节 听觉之异象第一

 第百三节 听觉之异象第二

 第百四节 触觉之异象第一

 第百五节 触觉之异象第二

 第百六节 嗅觉之异象

 第百七节 味觉之异象

 第百八节 有机感觉之异象

 第百九节 知觉之异象

第十二讲 说明篇 第六变式的心理学各论第二

 第百十节 内想之异状总论

 第百十一节 再想之异状

 第百十二节 构想之异状

 第百十三节 虚想之异状第一

 第百十四节 虚想之异状第二

 第百十五节 虚想之异状第三

 第百十六节 感情之异状

 第百十七节 意志之异状

 第百十八节 说明篇结论

 第百十九节 真怪论

 第百二十节 结论