《基因工程学》全书共12章，除第1章绪论外，其余各章主要阐述基因、工具酶、载体、重组DNA分子的转化与重组子筛选、核酸的分离纯化与目的基因的克隆、大肠杆菌基因工程、酵母菌基因工程、基因组、蛋白质工程、途径工程和合成生物学等内容。
本书的特色：①以实际操作为抓手，详细论述了基因工程的各个环节以及实验注意事项和实例；②重点讲述了以大肠杆菌为代表的原核微生物和以酵母菌为代表的真核微生物的基因工程技术；③基因组这一章节，详细讲述了三代DNA测序和多种基因组定点编辑（同源重组、RecET/Red重组系统、ZFN、TALEN和CRISPR-Cas系统）的原理，还介绍了与基因组学相关的自然科学和人文科学知识；④以蛋白质工程的实际应用为目标，介绍了基因改造的理性分子设计理论；⑤在讲述途径工程基本原理的基础上，以全新的角度论述了其在实际工作中的应用实例；⑥简要介绍合成生物学，以利于工程菌的准确管控。
《基因工程学》是针对生物工程、生物技术、生物制药专业本科生编写的教材，可供生物技术和生命科学相关专业的本科生使用，也可供研究生和有关科研人员参考。

第1章 绪论
1.1 基因工程的基本概念
1.2 基因工程的核心理论和核心技术
1.2.1 基因工程所依赖的核心理论
1.2.2 基因工程所依赖的核心技术
1.3 基因工程的建立与发展
1.3.1 基因工程的建立
1.3.2 基因工程的发展
1.4 基因工程的产业化及应用
1.4.1 基因工程的产业化
1.4.2 基因工程的应用
1.5 转基因生物的安全性与伦理
1.5.1 转基因生物的安全性
1.5.2 转基因生物的伦理
1.6 应用实例
1.6.1 问题的提出
1.6.2 生化产品生产中存在的问题
1.6.3 基因工程的用途
1.6.4 实例
第2章 基因
2.1 孟德尔“遗传因子”：生物性状遗传的符号
2.2 基因：位于染色体上的遗传功能单位
2.2.1 等位基因
2.2.2 复等位基因
2.3 顺反子：一个基因一条多肽
2.4 操纵子：遗传信息传递和表达的统一体
2.5 超基因
2.6 假基因
2.7 断裂基因
2.7.1 RNA剪接
2.7.2 内含子类型
2.8 重叠基因
2.9 可动基因
2.9.1 Ac-Ds系统
2.9.2 插入序列
2.9.3 转座子
2.9.4 P因子
2.9.5 反转录转座子
2.10 癌基因和抑癌基因
2.11 染色体外基因
2.11.1 质粒
2.11.2 线粒体基因
2.11.3 叶绿体基因
2.11.4 非孟德尔遗传
第3章 工具酶
3.1 限制性内切核酸酶
3.1.1 宿主的限制和修饰现象
3.1.2 限制性内切核酸酶的类型
3.1.3 限制性内切核酸酶的命名
3.1.4 影响限制性内切核酸酶活性的因素
3.1.5 限制性内切核酸酶对DNA的消化作用
3.1.6 限制性内切核酸酶反应的终止
3.1.7 限制性内切核酸酶酶切反应的操作步骤和注意事项
3.2 DNA聚合酶
3.2.1 DNA聚合酶Ⅰ（E.coli）
3.2.2 大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ的Klenow片段
3.2.3 T4 DNA聚合酶
3.2.4 依赖RNA的DNA聚合酶
3.2.5 T7 DNA聚合酶
3.2.6 修饰的T7 DNA聚合酶
3.3 DNA连接酶
3.3.1 大肠杆菌和T4噬菌体的DNA连接酶
3.3.2 影响连接反应的因素
3.3.3 DNA片段在体内和体外的连接——黏性末端的连接
3.3.4 平末端的连接
3.3.5 连接反应的注意事项
3.4 DNA及RNA的修饰酶
3.4.1 末端脱氧核苷酸转移酶
3.4.2 T4多核苷酸激酶
3.4.3 碱性磷酸酶
3.5 外切核酸酶
3.5.1 外切核酸酶Ⅶ
3.5.2 外切核酸酶Ⅲ
3.5.3 λ外切核酸酶和T7基因6外切核酸酶
3.6 单链内切核酸酶
3.6.1 S1核酸酶
3.6.2 Bal31核酸酶
3.7 细胞裂解酶
3.7.1 溶菌酶
3.7.2 蛋白酶K
3.7.3 纤维素酶
3.7.4 其他裂解酶
3.8 其他
3.8.1 琼脂糖酶
3.8.2 核酸酶抑制剂
第4章 载体
4.1 质粒载体
4.1.1 质粒的一般生物学特性
4.1.2 质粒载体的选择
4.1.3 常用的大肠杆菌质粒载体
4.2 噬菌体载体
4.2.1 单链噬菌体载体
4.2.2 双链噬菌体载体
4.3 黏粒载体
4.3.1 黏粒载体的组成
4.3.2 黏粒载体的特点
4.3.3 黏粒载体的应用
4.4 噬菌粒载体
4.4.1 噬菌粒载体的概念
4.4.2 pUC118和pUC119噬菌粒载体
4.4.3 pBluescript噬菌粒载体
4.5 人工染色体载体
4.5.1 酵母人工染色体载体
4.5.2 细菌人工染色体载体
4.5.3 P1人工染色体载体
第5章 重组DNA分子的转化与重组子筛选
5.1 DNA分子的转化与扩增
5.1.1 DNA重组转化的基本概念
5.1.2 受体细胞的选择
5.1.3 转化方法
5.1.4 转化率及影响因素
5.1.5 转化细胞的扩增
5.1.6 进行转化时的注意事项
5.2 重组体克隆的筛选与鉴定
5.2.1 遗传检测法
5.2.2 物理检测法
5.2.3 核酸杂交法
5.2.4 PCR检测法
5.2.5 克隆基因定位法
5.2.6 测序检测法
5.2.7 外源基因表达产物检测法
第6章 核酸的分离纯化与目的基因的克隆
6.1 核酸的分离纯化
6.1.1 核酸分离提取的原则
6.1.2 核酸的分离提取
6.1.3 质粒DNA的提取
6.1.4 RNA的提取
6.1.5 核酸的检测
6.2 目的基因的克隆
6.2.1 鸟枪法
6.2.2 cDNA法
6.2.3 PCR扩增法
6.2.4 化学合成法
6.2.5 基因文库的构建
第7章 大肠杆菌基因工程
7.1 外源基因在大肠杆菌高效表达的原理
7.1.1 启动子
7.1.2 终止子
7.1.3 核糖体结合位点
7.1.4 密码子
7.1.5 质粒拷贝数
7.2 大肠杆菌工程菌的构建策略
7.2.1 包涵体型异源蛋白的表达
7.2.2 分泌型异源蛋白的表达
7.2.3 融合型异源蛋白的表达
7.2.4 寡聚型异源蛋白的表达
7.2.5 整合型异源蛋白的表达
7.2.6 蛋白酶