章 几何形态测量学简介 1
节 物种、种群的概念及其判别方法 1
第二节 传统测量的缺陷 3
第三节 几何形态理论 5
第四节 几何形态测量方法 8
第五节 形态参数的分析方法 14
第六节 薄板条样分析 17
第七节 几何测量分析的基本步骤 18
第二章 几何形态测量在水生生物中的应用及研究展望 19
节 几何形态测量法在水生动物中的应用 19
第二节 研究展望 25
第三章 几何形态测量法应用软件 27
节 TPS系列（TPS series of software） 27
第二节 SHAPE 35
第三节 MorphJ 37
第四节 R语言程序相关加载包 46
第五节 PAST 47
第四章 鱼类耳石的研究应用 49
节 基于耳石形态学的生长分析 49
第二节 基于耳石形态学的种类判别分析 55
第五章 头足类耳石的研究应用 63
节 基于两种形态学方法的柔鱼类耳石判别比较研究 63
第二节 基于外形轮廓法的柔鱼类耳石判别研究 70
第三节 基于外形轮廓法的茎柔鱼种群判别分析 77
第四节 基于地标点法的茎柔鱼种群判别分析 86
第六章 头足类角质颚的研究应用 94
节 基于两种形态学方法的柔鱼类角质颚判别分析 94
第二节 基于外形轮廓法对我国近海枪乌贼类判别分析 102
第三节 地标点法对两种头足类上下颚的判别分析 110
第四节 基于改进地标点法的柔鱼角质颚种群判别分析 117
参考文献 127
附录 146

本专著共分五章内容。靠前章为几何形态测量学简介，重点分析了传统测量的缺陷、几何形态理论、地标点和形态参数的分析方法，以及几何测量分析的基本步骤。第二章为几何形态测量在水生生物的应用，主要介绍几何形态测量简史、几何形态测量方法，以及、几何形态测量法在水生动物中的应用现状。第三章为几何形态测量法应用软件，主要介绍了目前靠前上常用的TPS系列（TPSseriesofsoftware）、SHAPE、MorphJ、R语言程序相关加载包、PAST等5种方法。第四章为鱼类耳石的研究应用，以鱼类耳石为例，基于几何形态测量学对耳石形态学的生长研究，以及种类判别。第五章为头足类耳石的研究应用，以头足类的耳石为案例，基于外形轮廓法和地标点法的柔鱼类的种群进行判别。第六章为头足类角质颚的研究应用，以角质颚为材料，对柔鱼类、枪乌贼类的种类及其种群进行判别。