一、小乘阿毗达磨部
总叙
第一门 早期说一切有部论书
第一品 唐玄奘译《阿毗达磨法蕴足论》十二卷
第二品 唐玄奘译《阿毗达磨集异门足论》二十卷
第三品 北宋法护等译《施设论》七卷
第四品 唐玄奘译《阿毗达磨识身足论》十六卷
第五品 唐玄奘译《阿毗达磨品类足论》十八卷
附：刘宋求那跋陀罗等译《众事分阿毗昙论》十二卷
后汉安世高译《阿毗昙五法行经》一卷
唐法成译《萨婆多宗五事论》一卷
唐玄奘译《五事毗婆沙论》二卷
第六品 唐玄奘译《阿毗达磨界身足论》三卷
第七品 唐玄奘译《阿毗达磨发智论》二十卷
附：苻秦僧伽提婆等译《阿毗昙八犍度论》三十卷
第八品 苻秦僧伽跋澄等译《尊婆须蜜菩萨所集论》十卷
第九品 魏吴失译《阿毗昙甘露味论》二卷
第二门 中期说一切有部论书
第一品 唐玄奘译《阿毗达磨大毗婆沙论》二百卷
附：苻秦僧伽跋澄译《鞞婆沙论》十四卷
北凉浮陀跋摩等译《阿毗昙毗婆沙论》六十卷
第二品 东晋僧伽提婆等译《阿毗昙心论》四卷
附：北齐那连提耶舍译《阿毗昙心论经》六卷
刘宋僧伽跋摩等译《杂阿毗昙心论》十一卷
第三品 唐玄奘译《入阿毗达磨论》二卷
第三门 后期说一切有部论书
第一品 唐玄奘译《阿毗达磨俱舍论》三十卷
附：陈真谛译《阿毗达磨俱舍释论》二十二卷
唐玄奘译《阿毗达磨俱舍论本颂》一卷
唐失译《俱舍论实义疏》六卷
第二品 唐玄奘译《阿毗达磨顺正理论》八十卷
附：唐玄奘译《阿毗达磨藏显宗论》四十卷
第四门 其他佛教部派论书
第一品 上座部论书：姚秦昙摩耶舍等译《舍利弗阿毗昙论》三十卷
附：梁僧伽婆罗译《解脱道论》十三卷
东晋失译《那先比丘经》二卷
第二品 大众部论书：后汉失译《分别功德论》五卷
第三品 犊子部论书：陈真谛译《立世阿毗昙论》十卷
第四品 贤胄部论书：东晋僧伽提婆译《三法度论》三卷
附：苻秦鸠摩罗佛提等译《四阿含暮抄解》二卷
第五品 正量部论书：三秦失译《三弥底部论》三卷
附：北宋日称等译《诸法集要经》十卷
北宋日称等译《十不善业道经》一卷
第六品 经部论书：姚秦鸠摩罗什译《成实论》十六卷
附：陈真谛译《四谛论》四卷
……
二、小乘集传部
三、大乘中观部
四、大乘瑜伽部
五、大乘集传部

此藏为小乘论藏、大乘论藏的解说。全书分为五大部，依次为《小乘阿毗达磨部》《小乘集传部》《大乘中观部》《大乘瑜伽部》《大乘集传部》，共收录佛典二百三十五部一千七百四十一卷。这些典籍综罗小乘说一切有部、上座部、大众部、犊子部、贤胄部、正量部、经部等部派撰作的各种阿毗达磨论书；大乘中观派、瑜伽行派撰作的各种释经论、集义论；西域和东土佛教学者撰作的各类佛教集传。内容叙及：小乘佛教的主要教理“世间”说、“蕴处界”说、“五位七十五法”说、“缘起”说、“业”说、“烦恼”说、“四谛”说、“禅定”说、“道位”说；大乘中观派的主要教理“六波罗蜜”说、“十地”说、“十八空”说、“八不中道”说、“二谛”说；瑜伽行派的主要教理“十七地”说、“八识”说、“三自性”说、“三无性”说、“唯识五位”说、“五位百法”说、“如来藏”说、“因明”说等。