漂流在海上的波特莱尔三姐弟遇到海难，来到了一座孤岛上。奇怪的是，他们在这里找到了爸爸妈妈留在的笔记本，似乎可以揭开一直困扰他们的谜题。而他们的宿敌欧拉夫伯爵，也最后一次与他们狭路相逢。

奥薇特发现欧拉夫伯爵一动不动地躺在海滩上时，心中不禁好奇，是不是走到哪里，他们三姐弟都没办法摆脱这个坏蛋？
克劳斯在这座与世隔绝的小岛上发现了一间图书室，里面竟隐藏着自己父母的惊天秘密！三姐弟第一次知道父母真正的身份……
桑妮怎么也没有想到，竟然和失散已久的好朋友重逢了！虽然那位好朋友不会说话，却像以往那样，成为三姐弟的救命恩人。