《特种芯片003》是一本以寻找智能芯片为主要内容的科幻故事，发生在200年后的23世纪。故事讲述了：一艘来自火星的宇宙飞船发生爆炸后，一种特殊的病毒随着解体的飞船“入侵”了地球，爆发了大规模的病毒感染，人们不得不想方设法寻找病毒“克星” ——第003号芯片……
主人公迪迪是一只被派往地球的外星鼠，她的任务是潜伏在地球的动物医院搜集数据，以满足火星人的科学实验，帮助他们控制地球。但是，在地球上生活的时间里，迪迪与许多地球上的小动物结下了深厚的友谊，其中有小猫端端、小狗汪鸣、小老鼠杰杰等。在经历了许多的坎坷和磨炼，甚至是朋友离世的悲痛，迪迪终于下定决心找到第003芯片，解救地球上的生灵。