本套书光绪二年浙江书局刻荘逵吉校刊本为底本，校以道藏本、道藏辑要本（简称蜀藏本）、中立四子本（简称中立本）、茅一桂刻本（简称茅本）、刘泖生景写宋本（简称景宋本）、唐写本兵略残卷（简称古残卷）暨唐，宋类书所引及诸书凡淮南所出及出自淮南者。

上册
自序
凡例
叙目（高誘）
莊序
卷一 原道訓
卷二 俶真訓
卷三 天文訓
卷四 墜形訓
卷五 時則訓
卷六 覽冥訓
中册
卷七 精神訓
卷八 本經訓
卷九 主術訓
卷十 繆稱訓
卷十一 齊俗訓
卷十二 道應訓
卷十三 氾論訓
卷十四 詮言訓
下册
卷十五 兵晷訓
卷十六 說山訓
卷十七 說林訓
卷十八 人閒訓
卷十九 脩務訓
卷二十 泰族訓
卷二十一 要畧
附錄一 淮南子書目
附錄二 淮南子侠文
附錄三 淮南子總評
附錄四 各本序跋