章呼吸道病毒
节流行性感冒病毒
第二节麻疹病毒
第三节风疹病毒
第四节严重急性呼吸综合征冠状病毒
第五节中东呼吸综合征冠状病毒
第六节其他呼吸道病毒
第二章肠道病毒及腹泻相关病毒
节HFMD相关病毒
第二节肠道病毒70型与柯萨奇病毒A组24型变种
第三节诺如病毒
第四节轮状病毒
第五节肠道腺病毒
第六节星状病毒
第七节札如病毒
第三章虫媒病毒
节登革病毒
第二节汉坦病毒
第三节黄热病毒
第四节基孔肯雅病毒
第五节流行性乙型脑炎病毒
第六节发热伴血小板减少综合征布尼亚病毒
第七节寨卡病毒
第四章狂犬病病毒
第五章肝炎病毒
节甲肝病毒
第二节乙肝病毒
第六章埃博拉病毒
第七章艾滋病病毒
第八章原虫
节隐孢子虫
第二节疟原虫
第三节蓝氏贾第鞭毛虫
第四节刚地弓形虫
第五节利什曼原虫
第六节锥虫

为有效应对新发和再发传染病，实验室的精准诊断是重要前提。为规范深圳市疾病预防控制机构对新发再发传染性病毒和原虫的实验室诊断，依据《中华人民共和国传染病防治法》《中华人民共和国国家标准实验室生物安全通用要求（GB19489～2008）》及相关法律法规，参考世界卫生组织《实验室生物安全手册（第三版）》以及相关国家卫生行业标准、国家卫生健康委相关传染病检测技术工作规范等有关内容制定了本标准操作规程。本标准操作规程包括呼吸道病毒、肠道病毒、虫媒病毒等主要病毒和原虫的实验室检测工作规程。