这本《中医药系统生物学(精)》由罗国安、王义明、梁琼麟和刘清飞所著，是我们多年来开展中医药系统生物学研究的总结。全书共分十一章。第一章介绍了中医药系统生物学的概况，整合化学物质组学的整体系统生物学的提出和发展过程。第二章介绍了中药化学物质组学的定义和有关研究内容和方法。第三章提出了基于整体系统生物学的中药复方药代动力学研究模式。第四、五、六、七章分别介绍了基因组学、蛋白质组学、代谢组学、化学计量学与生物信息学的定义和相关内容、国际研究进展及其在中医药研究中的一些应用实例。第八至十一章分别介绍了基于研究对象的应用实例。第八章介绍了结合中西医临床诊断和治疗的糖尿病肾病的系统生物学研究。第九章以清开灵注射液为例，详细阐述了中药化学物质组学应用于中药复方的全局表征和局部特征，解决中药复方复杂体系和其药效相关的系统研究结果。第十章以中药复方双龙方的整体系统生物学研究结果阐述了我们提出的“系统-系统”研究体系、实施方法和相关技术。第十一章则介绍了我们用整体系统生物学开展对中药复方六神丸安全性评价的初步探索。

这本《中医药系统生物学(精)》由罗国安、王义明、梁琼麟和刘清飞所著，是清华大学中药现代化研究中心多年探索、创新研究工作的总结，系统阐述了作者在中医药系统生物学研究方面的学术思想、技术路线、方法体系及相关应用成果。全书原创性强，技术前沿，体现了以下特色：提出了适合中医药研究的中医药系统生物学研究体系；提出了创新的研究模式，即从“点-点”、“点-系统”发展到“系统-系统”的模式；阐述了创新的研究策略，针对复杂系统，提出采用层次化、整合各种组学(包括化学物质组学和系统生物学)的方法和逐步优化的策略来研究“系统-系统”的相互作用；阐述了创新的研究方式，针对化学和生物的复杂系统，提出采用整体表征和局部特征相结合、定性测定和定量测定相结合、多学科先进技术的整合等研究方式；发展了创新的研究方法和技术，如化学物质组学、定量代谢组学平台技术等。

《中医药系统生物学(精)》可作医药院校相关师生的学习参考书，也可供制药企业、科研院所从事中药研究与开发、药品生产和质量管理等相关专业技术人员和科研管理人员作为技术指导参考书。

序

自序

前言

第一章 中医药系统生物学概述

 1.1 传统中药方剂学的特色

 1.2 方剂配伍规律

 1.3 方剂学现代研究需要迫切解决的关键科学问题

 1.4 系统生物学的发展

 1.5 整合化学物质组学的整体系统生物学

 参考文献

第二章 中药化学物质组学研究

 2.1 化学物质组学提出和发展的背景

 2.2 化学物质组学

 2.3 中药的作用特点与研究难点

 2.4 中药化学物质组学与中药方剂研究

 2.5 中药化学物质组的获取方法和技术

 2.6 中药化学物质组分析表征的方法和技术

 2.7 中药化学物质组学研究中的信息处理方法和技术

 参考文献

第三章 基于整体系统生物学的中药复方药代动力学研究模式

 3.1 中药复方药代动力学研究的特点

 3.2 中药复方药代动力学的研究方法

 3.3 中药药代动力学的相关理论和假说

 3.4 中药成分在肠道的代谢处置

 3.5 中药复方PK-PD动态多维时空网络模式研究

 3.6 展望

 参考文献

第四章 基因组学在中医药研究中的应用

 4.1 基因组学概述

 4.2 后基因组学研究平台与技术

 4.3 miRNA、siRNA及RNAi技术

 4.4 药物基因组学

 4.5 基因组学应用于中药方剂研究

 4.6 基因组学与中药方剂的融合发展

 4.7 基因组学在中药研究中的应用实例

 参考文献

第五章 蛋白质组学在中医药研究中的应用

 5.1 蛋白质组学研究概述

 5.2 蛋白质组学与中药复方系统研究

 5.3 中药复方系统研究中蛋白质组学研究主要内容

 5.4 中医药蛋白质组学研究的局限及技术发展

 5.5 蛋白质组学应用于中医药研究的实例

 5.6 基于细胞的高内涵药物筛选系统在中医药中的应用

 参考文献

第六章 代谢组学在中医药研究中的应用

 6.1 代谢组学简介

 6.2 代谢组学的研究模式

 6.3 代谢组学的应用领域

 6.4 代谢组学应用于临床疾病研究

 6.5 代谢组学与中药方剂化学的相关性研究

 参考文献

第七章 化学计量学与生物信息学在中医药研究中的应用

 7.1 化学计量学简介

 7.2 中药方剂代谢组学的化学计量学支撑技术

 7.3 人工神经网络应用于代谢组学数据分析

 7.4 生物信息学概述

 7.5 生物信息学研究内容

 7.6 中医药生物信息学研究

 7.7 生物信息学相关数据库

 参考文献

第八章 糖尿病肾病的系统生物学研究

 8.1 糖尿病与糖尿病肾病简介

 8.2 糖尿病肾病的系统生物学研究方法

 8.3 糖尿病肾病的横断面研究

 8.4 糖尿病肾病的药物治疗研究

 8.5 结论

 参考文献

第九章 中药复方清开灵注射液化学物质组学研究

 9.1 概述

 9.2 清开灵注射液化学物质组的表征方法

 9.3 清开灵注射液药效学评价方法

 9.4 治疗脑水肿清开灵小方的配伍筛选

 9.5 清开灵小方中有效组分的制备工艺改进

 9.6 清开灵小方的配比优化

 9.7 清开灵小方有效组分配伍作用机制阐释

 9.8 研究小结

 参考文献

第十章 中药复方双龙方的整体系统生物学研究

 10.1 双龙方的中医药理论基础及现代研究的切人点

 10.2 双龙方化学物质组研究

 10.3 双龙方及有效组分配伍的药效学评价

 10.4 双龙方干预干细胞定向分化机制的基因组学研究

 10.5 双龙方干预干细胞定向分化机制的比较蛋白质组学研究

 10.6 双龙方的疗效评价与作用机理的代谢组学研究

 参考文献

第十一章 中药复方六神丸的安全性评价示范研究

 11.1 研究概述

 11.2 六神丸的药效研究——中药复方的有效性评价

 11.3 六神丸化学物质组学研究

 11.4 六神丸毒性再评价研究

 11.5 六神丸中蟾酥和雄黄体内分布及代谢研究

 11.6 六神丸安全性再评价研究小结

 11.7 六神丸代谢组学研究

 11.8 蟾酥急性毒性系统生物学研究

 参考文献

附录 作者近十年发表的与本书相关的论文论著

后记