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书名 生物信息学(全国高等农林院校十一五规划教材)
分类 教育考试-大中专教材-成人教育
作者 萧浪涛
出版社 中国农业出版社
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简介
编辑推荐

生物信息学是一门由生命科学、数学和计算机科学相互渗透形成的新型交叉学科,是生命科学在后基因组时代不可或缺的研究工具。本教材是普通高等教育“十一五”国家级规划教材和全国高等农林院校“十一五”规划教材。全书共九章,主要介绍了生物信息学的分子生物学基础,生物信息学的计算机基础,分子进化分析,基因组分析,生物芯片数据分析,核酸与蛋白质结构预测,生物信息学平台与工具软件等内容。

目录

前言

绪论

一、生物信息学的定义与内容

二、生物信息学的产生与发展

三、生物信息学的应用

四、生物信息学的学习方法

思考题

第一章 生物信息学的分子生物学基础

 第一节 生物大分子

一、蛋白质

二、核酸

 第二节 中心法则

一、DNA的复制

二、DNA到mRNA的转录

三、遗传密码

四、mRNA翻译为蛋白质

五、mRNA的反转录与cDNA

六、蛋白质的剪接

七、蛋白质的折叠

 第三节 基因工程

一、限制性核酸内切酶

二、聚合酶链式反应

三、基因克隆

四、DNA测序方法

 第四节 基因组和蛋白质组

一、基因组

二、蛋白质组

三、从基因组到蛋白质组

 思考题

第二章 生物信息学的计算机基础

 第一节 计算机网络与国际互联网

一、计算机网络

二、国际互联网

 第二节 生物信息学编程基础

一、Perl语言

二、PHP语言

 第三节 数据库管理与数据库技术

一、数据库管理

二、数据库技术

 第四节 数据仓库与数据挖掘

一、数据仓库

二、数据挖掘

 思考题

第三章 核酸序列分析

 第一节 核酸序列分析的意义

 第二节 算法和算法分析

一、序列分析模型

二、序列比对

 第三节 序列分析的实际操作

一、DNA的碱基组成

二、限制性核酸内切酶酶切位点分析

三、DNA序列的数据库检索

四、基于ClustalX的多重序列比对

 思考题

第四章 分子进化分析

 第一节 分子进化概论

一、分子进化的基本概念

二、生物大分子进化的特点

 第二节 分子进化学说与遗传模型

一、进化的分子钟

二、分子进化的中性学说

三、遗传模型和序列距离

 第三节 分子系统树构建

一、距离矩阵法

二、其他方法

三、分子系统树构建方法的差异

 第四节 系统树的统计分析与检验

一、树根的确定

二、枝长和物种分歧时间的估算

三、系统树的检验

 第五节 应用示例

 思考题

第五章 基因组分析

 第一节 基因组学概论

一、基因组学

二、基因组研究概况

 第二节 结构基因组学

一、基因组的测序原理

二、DNA分子标记技术

三、基因组作图

四、基因组结构中的多态性

 第三节 功能基因组学

一、功能基因组学的研究策略和内容

二、功能基因组学的主要分析方法

 第四节 比较基因组学

一、比较基因组学的基本原理

二、比较基因组学的主要研究方法

三、模式生物基因组的比较研究

 第五节 基因预测

一、基因预测的方法

二、基因组的功能注释

三、基因预测分析的一般步骤

 思考题

第六章 蛋白质组分析

 第一节 蛋白质组学概论

一、蛋白质组学的概念

二、蛋白质组分析的必要性

三、蛋白质组分析的主要方法

四、蛋白质组分析的技术路线和主要支持技术

 第二节 蛋白质组信息学

一、蛋白质组信息学概述

二、蛋白质功能分析

三、蛋白质翻译后修饰鉴定

四、蛋白质相互作用

 第三节 蛋白质组学的应用

一、人类医学蛋白质组研究

二、模式生物蛋白质组研究

三、其他应用

 思考题

第七章 生物芯片数据分析

 第一节 生物芯片概述

一、生物芯片的概念

二、生物芯片的类型

 第二节 生物芯片的制备

一、样品的制备

二、载体的选择及预处理

三、芯片的制备方法

四、点样后处理

 第三节 生物芯片反应信号检测

一、生物芯片反应信号检测概述

二、基于荧光标记的生物芯片反应信号检测技术

三、基于光散射的生物芯片信号检测

四、化学发光检测技术

五、薄膜检测技术

六、电化学检测技术

 第四节 生物芯片数据处理与分析

一、生物芯片扫描图像的处理与分析

二、数据的提取与分析

 第五节 生物芯片应用

 思考题

第八章 核酸与蛋白质结构预测

 第一节 RNA二级结构预测

一、RNA的二级结构与功能

二、RNA二级结构预测

三、RNA二级结构预测实例

 第二节 蛋白质结构预测

一、蛋白质二级结构预测

二、蛋白质三级结构预测

三、蛋白质跨膜区预测

 思考题

第九章 生物信息学平台与工具软件

 第一节 基于互联网的生物信息学平台

一、美国国立生物技术信息中心网站

二、欧洲分子生物学实验室网站

三、结构生物信息学合作研究实验室网站

四、其他生物信息学网络平台

 第二节 生物信息平台的本地化

一、Windows环境下BLAST工具的本地化

二、Linux环境下BLAST工具的本地化

三、其他生物信息学平台的本地化策略

第三节 生物信息学工具软件

一、生物信息学集成工具软件包

二、序列分析软件

三、其他生物信息学工具软件

附录1 GenBank数据注释语

附录2 生物信息学常用数据库

附录3 生物信息学相关词汉英对照

附录4 生物信息学相关词英汉对照

参考文献

随便看

 

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更新时间:2025/4/26 18:29:53