本书所说的“本源”是一个复合词，包括“根本”和“起源”两层意思。思想世界的根本是它的构成要素——文本。文本既有思想的内涵，又是思想的载体，文本在历史中流传，出现在世世代代的人面前，供人们理解、欣赏和批判。文本虽然重要，但不是世界的一切，文本的起源在文本之外的现实世界。但现实世界是人的世界，人性和人所生活的环境和他们所创造的文化，是历史中的个人创造文本的永无止境和永不枯竭的源泉。“回到思想的本源”，就是要回归到人性的起源和发展的那个进化过程，反思我们现在所处的思想世界的“原点”，从那里开始追寻文化传统之根和自我意识之源。

上篇　马克思哲学：正本清源

　研究马克思哲学与西方哲学的“正本清源”方案

　“物质”观念及其在马克思主义哲学中的嬗变

　西方人本主义的传统与马克思的“以人为本”的思想

　马克思哲学的中间原理

　波普尔对马克思：批判理性主义的批评和反批评

中篇　西方哲学：推本溯源

　西方哲学的危机和进化论转向

　现代达尔主义向社会领域的胜利进军

　人性科学何以可能

　图腾制是人类文明的起点

　宗教哲学的达尔文范式

　研究道德起源的达尔文范式

　逻辑和形而上学的起源

　在西方哲学文本的语境中理解Being的意义

　中国的西方哲学研究中的十个误解

　休谟的经验论真的摆脱了矛盾吗

下篇　中国哲学：返本开新

　关于中国文明起源问题的考古哲学思考

　保卫中国哲学

　中西形而上学的“同源分流”

　《孟子》的道德形而上学的体系

　《墨子》的功利主义体系

　中国古代价值律的重构

　中加古代价值律在政治哲学中的应用

　走向“黄铜时代”

　第一次中西文化交流得失之考察

　中国文化对西方现代性形成的作用

　西方汉学研究的“韦伯话语”

　“大哲学”视野中的现代中国的哲学

后记