《六书通》仿照《金石韵府》的体例，以《洪武正韵》统字。每一字楷书上列俗体字，下列《说文》中的小篆及反切，《说文》以大徐本《说文》为主。凡是《说文》中的部首字，均标明“建首”二字，然后列古文﹑籀文﹑钟鼎彝器以及秦汉公私印章。凡是《说文》所无者，均注明出处，自为注解，并引经史加以证明。此书为后世保存了大量的字的不同形体，闵氏《凡例》说：“灼然乖悖者，芟之稍涉疑似，安知古人之不出于疑似也，现当并存以俟千古。”凡是一笔一划不同者并录，保存了大量的字体。特别是其书引用的古器物和秦汉印章，为我们保存了大量的古体字，能够为我们的古文字研究提供一定的线索。这本书本身就是为了保存字体，也是研究汉字字体演变及书法篆刻的工具书。

六书通总目
上平声第一
一 东
二 支
三 齐
四 鱼
五 模
上平声第二
六 皆
七 灰
八 真
九 寒
十 删
下平声第三
十一 先
十二 萧
十三 爻
十四 歌
十五 麻
十六 遮
下平声第四
十七 阳
十八 庚
十九 尤
二十 侵
二十一 覃
二十二 盐
上声上第五
一 董
二 纸
三 荠
四 语
五 姥
六 解
七 贿
八 轸
九 旱
十 产
上声下第六
十一 铣
十二 筱
十三 巧
十四 哿
……
去声上第七
去声下第八
入声下第十
六书通摭遗总目
上平声上第一
上平声下第二
下平声上第三
下平声下第四
上声上第五
上声下第六
去声上第七
去声下第八
入声上第九
入声下第十