第一篇 基础知识
第一章 光
第一节 光的本质
第二节 光的传播
第三节 自然光与偏振光
第四节 光的干涉与衍射
第二章 光学透镜
第一节 透镜的种类
第二节 透镜的性能
第三节 透镜的性质
第四节 透镜成像规律
第三章 晶体及其透光特性
第一节 晶体
第二节 晶体的折光特性及常见晶体的光学器件
第二篇 光学显微镜
第一章 普通光学显微镜
第一节 光学放大器件
第二节 照明器件
第三节 机械器件
第四节 显微镜的照明方式
第五节 显微镜的光轴调中
第六节 显微镜的光学参数
第二章 相差显微镜
第一节 相差显微镜光学原理
第二节 相差显微镜的结构特点
第三节 相差显微镜光路图
第四节 相差显微镜的使用范围、操作步骤及注意事项
第三章 微分干涉显微镜
第一节 微分干涉显微镜特殊光学元件
第二节 微分干涉显微镜光路图及其光学原理
第三节 微分干涉显微镜使用方法及其注意事项
第四章 暗视野显微镜
第一节 暗视野显微镜原理与结构
第二节 暗视场光挡的制作方法
第三节 暗视野显微镜的使用方法
第四节 暗视野显微镜使用时的注意事项
第五章 荧光显微镜
第一节 荧光物质
第二节 荧光显微镜结构特点及其原理
第三节 荧光显微镜的种类
第四节 荧光显微镜的使用方法
第五节 荧光显微镜使用中的注意事项
第六节 荧光显微镜标本制作要求
第七节 荧光图像的记录方法
第三篇 电镜技术
第一章 电子显微镜基础
第一节 光学显微镜的分辨极限
第二节 电子显微镜的分辨率
第三节 电磁透镜
第四节 电磁透镜的像差
第五节 电子显微镜的类型
第二章 透射电子显微镜
第一节 透射电子显微镜的发展简史
第二节 透射电子显微镜的基本结构
第三节 透射电镜的成像原理
第四节 冷冻电镜和球差色差校正透射电镜
第三章 扫描电子显微镜
第一节 扫描电子显微镜的发展简史
第二节 扫描电子显微镜的基本结构与成像原理
第三节 扫描电镜的主要性能与应用
第四节 环境扫描电镜
第四章 水生生物电镜研究的主要技术方法
第一节 超薄切片技术
第二节 负染色技术
第三节 冷冻电镜三维重构技术
第四节 扫描电子显微镜生物样品制备技术
第四篇 荧光显微镜在水产生物研究上的应用
实验一 藻类细胞核的荧光观察
实验二 吖啶橙区分活细胞DNA和RNA的荧光组织化学染色法
实验三 鱼类染色体的荧光观察
实验四 刺参体腔细胞滴片的间接免疫荧光
实验五 细菌滴片的间接免疫荧光
实验六 水中细菌荧光记数方法(AODC法)
实验七 水及沉积物中活细菌荧光计数方法
第五篇 水生生物电镜实验技术
第一章 透射电镜样品制备技术
实验一 常规生物样品超薄切片制备
实验二 微生物及游离细胞超薄切片制备
实验三 刺参体腔细胞的超薄切片制备
实验四 海绵超薄切片制备
实验五 浮游病毒的负染色样品制备
第二章 扫描电镜样品制备技术
实验六常规生物扫描电镜样品制备
实验七微生物及游离细胞扫描电镜样品制备
实验八刺参体腔细胞的扫描电镜样品制备
第三章 水生生物超微结构及透射电镜观察
实验九水生生物细胞常见超微结构观察
实验十透射电镜观察
附录常用缓冲液及其配制方法
参考文献

第一篇介绍了光学显微镜物体成像的两大要素——光和透镜的基本知识，主要介绍了光的本质、光传播的基本特点，透镜的种类、性能、性质及其成像规律，晶体及光在其中的传播特性，此篇内容为理解第二篇中的几种光学显微镜成像原理奠定了基础。
第二篇介绍了几种常见光学显微镜的用途、成像原理、附件组成、使用方法，包括普通光学显微镜、相差显微镜、微分干涉显微镜、暗视野显微镜、荧光显微镜。此外，在普通光学显微镜部分增加了聚光器的正确使用方法和双目镜的调试方法。荧光显微镜部分增加了荧光物质的发光特点和染色条件及其使用范围。
第三篇介绍了从光学显微镜的分辨率极限到电镜分辨率进一步提升的基本知识，电镜电磁透镜的特性及电子显微镜的类型；之后着重介绍了两种基本类型的电子显微镜——透射电镜和扫描电镜的结构、成像原理、主要发展类型及应用；最后介绍了其在水生生物领域电镜研究的主要技术方法，包括透射电镜的超薄切片技术、负染色技术和冷冻电镜三维重构技术以及扫描电镜的生物样品制备技术。
第四篇主要介绍了荧光显微镜在水产养殖相关学科研究的一些实验技术．包括藻类细胞核的荧光观察、吖啶橙区分活细胞中的DNA和RNA的荧光组织化学方法、鱼类染色体的荧光观察、刺参体细胞滴片的间接免疫荧光及细菌的间接免疫荧光观察、水中细菌荧光记数方法。
第五篇介绍了水生生物领域的电镜实验技术。着重介绍了透射电镜和扫描电镜水生生物常规及特殊样品的制备技术。简要介绍了水生生物常见超微结构的观察和透射电镜观察方法。
张东升主编的《光镜与电镜技术及其在水生生物上的应用》为广大使用光学显微镜和电子显微镜的科研、教学、生产人员及学生等提供了更具系统性的使用技术参考书。