第1章 绪论

 1.1 产生背景和意义

 1.2 知识基础

 1.3 发展简史和现状

 1.4 数据库及技术工具

 1.5 技术难点与发展趋势

 1.6 本章小结

 思考题

第2章 数据处理方法基础

 2.1 引言

 2.2 概率论基础

 2.3 数据预处理

 2.4 数据分类分析

 2.5 数据聚类分析

 2.6 关联规则发现

 2.7 隐马尔科夫模型

 2.8 数据处理效果评价

 2.9 高维数据处理

 2.10 本章小结

 思考题

第3章 序列比对方法

 3.1 引言

 3.2 序列比对知识基础

 3.3 主要技术方法及分析

 3.4 双序列比对

 3.5 多序列比对

 3.6 应用实例分析

 3.7 本章小结

 思考题

第4章 系统发生树构建方法

 4.1 引言

 4.2 系统发生树知识基础

 4.3 主要技术方法及分析

 4.4 基于距离的构建方法

 4.5 基于离散特征的构建方法

 4.6 Quartet方法

 4.7 应用实例分析

 4.8 本章小结

 思考题

第5章 基因芯片数据处理方法

 5.1 引言

 5.2 基因芯片知识基础

 5.3 主要技术方法及分析

 5.4 基因芯片数据预处理

 5.5 基因芯片数据聚类分析

 5.6 基因芯片数据分类分析

 5.7 应用实例分析

 5.8 本章小结

 思考题

第6章 RNA结构预测方法

 6.1 引言

 6.2 RNA知识基础

 6.3 主要技术方法及分析

 6.4 比较序列分析方法

 6.5 动态规划算法

 6.6 组合优化算法

 6.7 启发式算法

 6.8 应用实例分析

 6.9 本章小结

 思考题

第7章 蛋白质结构预测方法

 7.1 引言

 7.2 蛋白质结构知识基础

 7.3 主要技术方法及分析

 7.4 蛋白质二级结构预测

 7.5 蛋白质三级结构预测

 7.6 应用实例分析

 7.7 本章小结

 思考题

第8章 生物分子网络构建方法

 8.1 引言

 8.2 生物分子网络知识基础

 8.3 主要技术方法及分析

 8.4 基因调控网络构建方法

 8.5 蛋白质互作网络构建方法

 8.6 应用实例分析

 8.7 本章小结

 思考题

参考文献

罗森林、潘丽敏、马俊编著的《生物信息处理技术与方法》共分8章，主要内容包括生物信息处理知识基础、数据处理方法基础、序列比对方法、系统发生树构建方法、基因芯片数据处理方法、RNA结构预测方法、蛋白质结构预测方法、生物分子网络构建方法等。

本书可用作计算机科学与技术、生命信息工程、软件工程、通信与信息系统等相关学科、专业的教材，也可作为参考书直接使用，同时也可供科研人员参考和有兴趣者自学使用。

生物信息数据的快速增长迫切需要生物信息处理技术与方法的有效应用和发展，生物信息处理涉及内容非常广泛，学科问相互交叉，互融关系复杂，罗森林、潘丽敏、马俊编著的《生物信息处理技术与方法》梳理了生物信处理技术与方法的知识点，注重领域内核心思想、原理、方法的论述，并融入国内外最新研究进展，内容力求系统、全面、先进。在讨论技术与方法的同时，引入应用实例以强调其具体应用方法，使理论联系实际，有利于技术与方法的快速掌握和有效运用。