生物信息学是一门新兴的交叉学科。在该领域中，由生物学家和计算机科学家共同研究生物分子信息的获取、管理、分析和利用。生物信息学以计算机、网络为工具，用数学和信息科学的理论、方法和技术去研究生物大分子，研究生物分子信息组织的规律。

本书从初学者及应用的角度对生物信息学分析所涉及的几个方面进行了介绍，提供了一些重要的常用软件的基本性能、获取方法和简单的使用步骤，力图通过最简单直观的方式使初学者能在最短的时间内了解生物信息学软件的基本功能，而不着眼于对软件功能以及所涉及算法的全面介绍。全书共分为四章，从计算机基础知识入手，以核酸和蛋白质序列分析为重点，由浅入深地介绍涉及核酸与蛋白质序列分析与研究的各个方面。

本书是在西南交通大学实验室及设备管理处“323基础实验教学平台”建设项目的资助下，由生命科学与工程学院生物系生物信息学专业部分师生集体编著，面向生物信息学软件的初学者，是一本实用性极强的操作指南。本书内容新颖、语言流畅、图文并茂、篇幅适当，操作实例具体而典型，可作为生命科学各专业本科生、研究生实验教材，也可供其他专业师生和科研人员以及广大生物信息学入门和提高的读者参考使用。

第一章　计算机应用基础

 第一节　Word的使用

 第二节　Excel的使用

 第三节　Foxmail的使用与设置

 第四节　Linux操作系统简介

 第五节　数据库的设计、制作和应用

第二章　分子生物学基础

 第一节　序列格式转换

 第二节 序列分析——BioEdit

 第三节 序列分析——cLc Free Workbench

 第四节　序列分析——Accelrys Gene

 第五节 引物设计——PriIner Premier

 第六节　DNA序列的多态性分析

 第七节　凝胶电泳图像分析

第三章　生物信息学软件

　第一节 多序列比对——Clustal X

　第二节　进化分析

　第三节　蛋白质分析

　第四节　蛋白质生物信息分析的基本技术与方法

　第五节　蛋白质结构显示

　第六节　三维结构比较

　第七节　系统发育树的显示与打印

第四章　生物信息学网络资源

　第一节　生物信息学数据库

　第二节　GCG Wisconsin软件包

　第三节　文本数据挖掘分析