本书共分8章，每章围绕一个主题展开。第一章介绍东山珊瑚自然保护区的总体情况，包括保护区的海洋环境、东山珊瑚的特色、主要威胁与保护；第二章介绍东山珊瑚礁保护区的自然环境，包括了保护区的地理位置及地质地貌、海洋气象与水文环境等；第三章论述东山的海洋理化环境状况、污染情况与水环境质量的调查、评价等；第四章全面阐述东山县周边海域的石珊瑚种类、资源及其分布；第五章阐述东山海域的其他生物资源及其分布，包括获得的浮游植物与浮游动物的调查结果，以揭示该保护区内丰富的浮游生物类群及其多样性，综述了该区的潮间带生物与底栖生物资源；第六章展示出该区柳珊瑚物种资源的丰富性和生态多样性；第七章，重点介绍东山造礁石珊瑚的共生藻及其遗传多样性；第八章介绍东山珊瑚的保护、管理与规划。

第一章 总论

 第一节 东山珊瑚省级自然保护区的一般情况

 第二节 东山珊瑚的特色

 第三节 东山珊瑚生态系统的生物多样性

 第四节 东山珊瑚受到的威胁与保护

第二章 东山自然保护区的自然环境

 第一节 地理位置及地质地貌

 第二节 海洋气候与水文

第三章 保护区的主要海洋环境因素

 第一节 珊瑚保护区的理化环境

 第二节 珊瑚保护区的水环境质量调查与评价

 第三节 污染源来源调查

 第四节 结论与采取措施

第四章 保护区的珊瑚资源

 第一节 珊瑚资源调查的内容和方法

 第二节 调查结果

第五章 保护区的其他生物资源

 第一节 浮游植物

 第二节 浮游动物种类及其分布

 第三节 潮间带生物

 第四节 底栖生物

第六章 东山湾海域柳珊瑚的物种多样性及其分布

 第一节 材料与方法

 第二节 结果

 第三节 讨论

第七章 东山湾造礁石珊瑚共生藻的分类和遗传多样性

 第一节 材料与方法

 第二节 结果

 第三节 讨论及结论

第八章 东山珊瑚自然保护区的保护与管理

 第一节 东山珊瑚自然保护区概况

 第二节 东山珊瑚自然保护区的保护和管理规划

参考文献