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本书旨在介绍分子模拟技巧的基本原理与其在实际体系中的应用。分子模拟的方法通常包括以量子力学与经典力学为基础的两部分。为了适应各种领域的读者,本书只介绍以经典力学为基础的模拟方法,并强调这些方法的应用。分子模拟方法已发展数十年,适用的范围愈来愈广、精确度愈来愈高,已成为材料、溶液、表面、生化、药物等方面研究不可缺少的工具。
分子模拟技术是一项广泛应用于材料、化学、生化与药物研究的通用技术。通过计算模拟,可以得出实验无法得到的资料,因此该技术应用领域十分广泛。但由于其公式较多,一直以来都令人感觉深奥难懂。本书在写作过程中略去公式的繁琐推导,力图结合丰富的应用实例使读者尽快掌握各种模拟方法的精髓。书中具体介绍了分子力学方法、分子动力模拟、蒙地卡罗计算及布朗动力模拟等方法。图文并茂,实例生动。
本书适用于从事材料、生物化学以及药学相关专业的研究人员,以及相关专业学生使用。
第1章 分子模拟的概况
第2章 力场
第3章 能量最小化
第4章 分子力学的应用
第5章 分子动力模拟计算的原理
第6章 特殊形态的分子动力计算
第7章 分子动力计算的应用
第8章 分子动力计算的应用实例
第9章 长程作用力的计算
第10章 蒙地卡罗计算方法
第11章 蒙地卡罗计算的应用
第12章 蒙地卡罗计算的实例
第13章 布朗动力计算方法
第14章 耗散粒子动力计算法
第15章 溶解自由能
第16章 生化分子系统的模拟
第17章 分子模拟与药物设计
附录A 经典运动力学
附录B 统计力学
附录C 天然存在的氨基酸的结构
索引
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