本书是一部关于噬菌体的理论专著,全书以浅显易懂的语言,对λ噬菌体的两条完全不同的生长发育途径进行了深入细致的描述,揭示了控制这一过程的基因开关的分子机制。书中配有近百幅生动形象的插图,帮助读者理解看似深奥复杂的基因调控的分子机制。
本书的第1版就已经成为描述基因调控的经典论著,它以简明的分子术语解释了病毒入在细菌体内生长过程中蛋白质是如何结合到DNA上并对基因进行开关控制的机理。现在的第3版,在对第1版的内容进行修改的基础上,作者增加了一章,专门介绍最近的新进展,以进一步加深和扩展读者对入噬菌体舶“基因开关”的理解。
本书以浅显易懂的语言,对λ噬菌体的两条完全不同的生长发育途径进行了深入细致的描述,揭示了控制这一过程的基因开关的分子机制。书中配有近百幅生动形象的插图,帮助读者理解看似深奥复杂的基因调控的分子机制。
本书尤其适合分子生物学、发育生物学、细胞生物学、遗传学和生物化学等专业的高年级本科生、研究生以及相关科研人员阅读。
绪论
1 调控的主要因素
1.1开关的组分
1.1.1DNA
1.1.2RNA聚合酶
1.1.3阻抑物
1.1.4Cro
1.2阻抑物和Cro的作用
1.2.1负调控
1.2.2正调控
1.2.3阻抑物结合的协同效应
1.3诱导——扳动开关
1.4协同效应——开关的稳定性和灵敏性
1.5自我调节的作用
1.6其他情况
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2 蛋白-DNA相互作用和基因调控
2.1操纵基因
2.2阻抑物
2.3Cro
2.4氨基酸-碱基对之间的相互作用
2.5启动子
2.6基因调控
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3 控制回路——设置开关
3.1λ生长的简单概述
3.1.1遗传图谱
3.1.2环化
3.1.3基因表达
3.1.4整合
3.2转录的调控
3.2.1极早期
3.2.2早期
3.2.3晚期裂解
3.2.4晚期溶原化
3.3决定
3.4整合和切除的控制
3.4.1情况1——建立溶原化
3.4.2情况2——裂解生长
3.4.3情况3——诱导
3.5其他噬菌体
3.6SOS反应
3.7λ途径和细胞发育
3.7.1调节基因
3.7.2开关
3.7.3基因表达模式
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4 关键实验的启示
4.1阻抑物概念
4.1.1清澈和毒性突变
4.1.2免疫力和异种免疫力
4.1.3细菌交配的不对称性
4.220世纪60年代早期的阻抑物蛋白
4.3阻抑物的分离和DNA结合
4.4制造更多阻抑物
4.5第1章、第2章的解释
4.5.1阻抑物的组成
4.5.2阻抑物的二聚化
4.5.3阻抑物二聚体与操纵基因位点的结合
4.5.4右向操纵基因与Cro的结合
4.5.5阻抑物与OR的结合
4.5.6溶原体中阻抑物的结合及其转录调控
4.5.7Cro与OR的结合
4.5.8RecA切割阻抑物引起诱导作用(图1-21)
4.5.9当Cro结合到OR3时开关被打开(图1-24)
4.5.10阻抑物和Cro与操纵基因的结合
4.5.11阻抑物通过结合OR2并通过它的氨基端结构域与聚合酶的接触激活cI的转录
4.6结论
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研究论文
5 2004:新进展
5.1长程协同效应和PRM的抑制
5.1.1阻抑物八聚体结合OR和OL
5.1.2阻抑物合成的自我负调控
5.1.3长程相互作用和PR的阻抑作用
5.1.4长程相互作用和PRM的阻抑作用
5.1.5PRM的激活和阻抑
5.1.6阻抑物结构
5.2正调控(转录激活)
5.2.1聚合酶和启动子
5.2.2激活机制
5.2.3激活区域的变种
5.2.4pc突变的抑制基因(suppressor)
5.2.5晶体学
5.2.6激活旁路
5.2.7改变激活区域和靶点的上下游序列
5.3阻抑物单体的结构和阻抑物断裂的机制
5.4开关的进化
5.4.1改变OR中位点对阻抑物的亲和力
5.4.2除去正调控
5.4.3除去DNA结合二聚体之间的协同性
5.5CⅡ和决定
参考文献:书籍和综述
参考文献:研究论文
附录
A1设计有效的DNA结合蛋白
A1.1大纲
A1.2特异性和非特异性结合
A1.3增加特异性
A1.4利用协同性
A1.5真核生物中的DNA蛋白相互作用
进一步阅读:研究论文
A2强弱相互作用
索引