本书首次在国内外用《动物比较育种学》的书名出版。作者以独特的思维方式——“创新来自灵感，灵感源于实践”来认识、分析当前畜禽育种中存在的问题，并提出解决问题的建议和方法。该书内容中，比较与创新、畜禽育种的要点和难点、混合家系亲缘相关、数量性状隐性有利基因的选择、畜禽保种优化方案、猪和肉鸡基因组选择策略以及混合家系群体平均亲缘相关与群体有效大小互为反比的证明，都是在其他有关动物育种的书中所没有的。在“育种的核心是选种，选种的关键是提高选择的准确性”的思想指导下，从群体和分子两个层面介绍“过去成功、现在有效”的方法，不一味追求“分子”。因为这是一本关于畜禽育种的书，要学以致用，不是在写文献综述。本书的读者对象主要是高等农业院校的教师和研究生，以及农业科研院所的研究人员。考虑到教师开课的需要和便于青年人的自学，在征得出版社的同意后，出版与精装本同样内容的平装本，降低了售价并加以“十四五”规划教材的标识。

绪论
一、育种学与现代种业
二、育种学与比较育种学
三、新中国成立以来畜禽育种科技的发展历程
四、今后的努力
第一章比较与创新
第一节有比较才有鉴别，有比较才有创新
第二节创新的内涵
第三节通过比较育成节粮小型蛋鸡——原始创新
第四节闭锁与开放相结合的猪育种体系——集成创新
第五节从技术上解决引进种畜退化问题——引进、消化吸收再创新
第二章育种目标与选择性状
第一节育种目标
第二节选择性状分类
第三节畜禽育种中选择的主要性状
第四节畜禽育种的要点和难点
第三章育种参数第一节表型参数及其应用
第二节遗传参数及其应用
第三节混合家系亲缘相关及其应用
第四章群体层面的选种方法
第一节选种的理论依据
第二节选择有极限吗？
第三节影响选择效果的因素
第四节数量性状的遗传分析
第五节选种方法的分类
第六节个体育种值估计
第七节复合育种值
第八节BLUP育种值
第九节选择指数
第十节数量性状隐性有利基因的选择（一个果蝇模拟试验）
第五章分子层面的选种方法
第一节转基因育种
第二节动物克隆与转基因动物克隆
第三节数量性状基因座与标记辅助选择
第四节全基因组关联分析
第五节基因组选择
第六节基因编辑
第七节动植物分子设计育种比较
第六章繁育体系
第一节基本概念
第二节繁育体系的形式
第三节各种畜禽繁育体系评述
……
第七章杂交与杂种优势利用
第八章动物遗传资源的保护
第九章肉用动物育种
第十章乳用动物育种
第十一章毛皮用动物育种
第十二章马属家畜育种
第十三章蛋禽育种