《日本朱子学派之哲学》（1905年）与《日本阳明学派之哲学》（1900年）、《日本古学派之哲学》（1902年）被称为井上“儒学三部曲”，是近代日本儒学史的奠基性著作。本书是“儒学三部曲”中最晚完成的一部，但处理的却是江户思想史中最为主流的部分，即以日本朱子学为核心的正统儒学。本书梳理了朱子学在日本的发展脉络，将其分为藤原惺窝及惺窝系统、惺窝系统以外的朱子学派、南学及暗斋学派、宽政以后的朱子学派、水户学派，并就其中有代表性的思想家的事迹、著书、学说、学风、主要门人等进行了考察。井上特别强调了朱子学在普及儒家伦理方面的教育功能，以此指出其在现代社会仍然具有不可忽视的实际能量。同时，日本的朱子学与中国的朱子学有何种关键差异？日本的朱子学盛极而衰的历史与它所遗留的课题应该如何在日本思想史中加以定位？本书在这些关键点上均提供了重要启示，有助于我们把握中国儒学的独特贡献，弘扬中国文化的精神。

序
凡例序论
第一篇藤原惺窝及惺窝系统
第一章藤原惺窝
第一事迹
第二著书
第三学说
第四惺窝门人
第五惺窝相关书籍
第二章林罗山
第一事迹
第二著书
……
结论
附录
译后记