介绍 |
Arlequin绿色版是一款小巧实用的专业化人类遗传学数据分析工具,Arlequin绿色版功能全面,能够完美服务于从事医学、生物学研究的用户,Arlequin软件操作十分的简单,支持用户快速地对统计数据中的信息进行挖掘,软件还可以进行AMOVA计算、中性检验、错配分布等。  Arlequin基本简介 Arlequin绿色版是一款专业的人类遗传学数据分析软件,这款软件主要为从事医学、生物学研究的用户设计,可以从遗传学和人口统计学数据中中挖掘信息,例如:大量的分子序列数据和传统的等基因频率,并提供了很多的方法和统计学检验,能够满足用户多种遗传学分析方便的需求!集成了单倍型频率估计、Tajima中性检验、Fu中性检验以及遗传距离的估计等功能。这样就能够准确有效的对人类遗传学数据进行挖掘。还在等什么,对遗传学有兴趣的用户可以通过软件对统计数据中信息的挖掘,可进行AMOVA计算、中性检验、错配分布等。 Arlequin软件特色 1.Molecular diversity(分子多态性); 2.Mismatch distribution(错配分布); 3.Haplotype frequency estimation(单倍型频率估计); 4.Linkage disequilibrium(连锁不平衡:检测不同位点上等位基因的非随机关联); 5.Hardy-Weinberg equilibrium(哈温—伯格平衡); 6.Tajima`s neutrality test(Tajima中性检验); 7.Fu`s neutrality test(Fu中性检验); 8.Ewens-watterson neutrality test(Ewens-watterson中性检验); 9.Chakraborty`s amalgamation test (Chakraborty`s 融合检验,检测人群的均一性或同质性和中性选择等); 10.Minimu Spanning Network(最小扩张树或称之为最小支撑树,,基于分子差异); 11.AMOVA 分子差异度分析,用以评测人群的遗传结构; 12.Pairwise genetic distances (遗传距离的估计); 13.Exact test of population differentiation (检测随机交配群体单倍型的非随机分布); 14.Assignment test of genotype (通过估计等位基因频率将单个基因型分配到特定的人群中); Arlequin更新日志 1.直接从DNA序列数据计算位点频谱,但仅基于次要等位基因频谱的SFS计算。 2.无法打开批处理(.arb)文件。 3.当(假设祖先等位基因0)在一个站点不存在时,SFS计算不良。 4.由arlequin和fastsimcoal2生产的不同SFS(主要用于基于MAF的SFS)。 5.如果文件名超过255个字符,则会出错。 6.在arlequin日志文件中没有提到SFS计算。特别说明: 您好,您即将使用的软件为辅助类工具,可能会被各大杀毒软件进行拦截和查杀,该软件可能存在使用风险,请注意规避,如果您想继续使用建议关闭各种杀毒软件后使用。 附软件包解压密码:www.onlinedown.net 小编推荐: Arlequin,软件是一款非常实用的软件,经过不断优化,功能非常不错,强烈推荐需要的用户下载体验,此外还推荐大家使用91助手、证照管家、多宝视多媒体视觉训练系统、PDFdo TXT To PDF、SEP Writer等,快来下载吧 |