《微生物学》第2版沿袭第1版的编写特色及编写体系，结合微生物学科发展的新成就与新进展，对全书内容进行修订与完善。本书由上海交通大学邓子新院士牵头，国内9所高校从事微生物学教学、科研工作的老师共同编写而成，把握微生物学近几十年来迅猛发展的脉络，从微生物的形态结构入手，再论及微生物分子生物学和基因重组技术，并对微生物生态学、宏基因组学与微生物演化进行了阐述，反映了现代微生物学和微生物生物技术发展的主流。全书共分15章，内容包括绪论、原核生物的结构与功能、真核微生物的结构与功能、病毒、微生物的营养、微生物的生长和控制、微生物代谢、微生物遗传与育种、微生物系统发育与分类、微生物生态与环境微生物、病原微生物、传染与免疫、微生物与食品、微生物与农业、工业微生物与发酵。
本书采用“纸质教材+数字课程”的出版形式，纸质教材内容精炼，各章均设置了知识导图、开放讨论题、推荐阅读等辅学内容；数字课程资源包括发现之路、知识拓展、科技视野、技术应用、视频、动画、教学课件、自测题、参考文献等内容，有助于学生自主学习，更好地掌握知识点。
本书可作为高等院校生物技术、生物工程、生物制药、生物科学、生物信息学等专业的教学用书，也可供从事相关研究和开发的人员参考。

1 绪论
1.1 微生物与微生物学
1.1.1 什么是微生物与微生物学
1.1.2 微生物的特点
1.1.3 微生物对人类的影响
1.2 微生物学的发展历程
1.2.1 微生物的发现
1.2.2 巴斯德与微生物学奠基
1.2.3 科赫与微生物学奠基
1.2.4 20世纪微生物学的快速发展
1.3 微生物学的未来
1.3.1 微生物多样性与微生物组学研究
1.3.2 基因工程菌的构建与大规模应用
1.3.3 利用微生物治理环境污染
1.3.4 新型传染病的防治
1.4 如何学习微生物学
1.4.1 微生物学的学习目标
1.4.2 学习微生物学的方法与建议
2 原核生物的结构与功能
2.1 原核生物的细胞结构概述
2.1.1 原核生物的外部形态
2.1.2 原核细胞的结构
2.2 细胞膜
2.2.1 细菌细胞膜的结构
2.2.2 古菌细胞膜的结构
2.2.3 细胞膜的功能
2.3 细胞壁
2.3.1 细菌的细胞壁
2.3.2 缺壁细菌
2.3.3 古菌的细胞壁
2.4 拟核与质粒
2.4.1 拟核
2.4.2 质粒
2.5 细胞表面结构与功能
2.5.1 细菌鞭毛与菌体运动
2.5.2 菌毛与性毛
2.5.3 糖被结构
2.5.4 菌鞘
2.5.5 茵柄
2.6 细胞质与内含物结构
2.6.1 70S核糖体
2.6.2 内生芽孢
2.6.3 颗粒状内含物
2.6.4 气泡
3 真核微生物的结构与功能
3.1 真核微生物细胞的结构与功能
3.1.1 细胞壁
3.1.2 细胞膜
3.1.3 细胞核
3.1.4 细胞质和细胞器
3.1.5 细胞表面附属物
3.2 真核微生物的分化
3.2.1 真菌的营养体和繁殖体
3.2.2 其他真核微生物的分化
3.3 真核微生物的起源、分类和分子演化
3.3.1 真核微生物的起源
3.3.2 真核微生物的主要类群
3.3.3 真核微生物的分子演化
4 病毒
5 微生物的营养
6 微生物的生长和控制
7 微生物的代谢
8 微生物的遗传与育种
9 微生物的系统发育与分类
10 微生物生态与环境微生物
11 病原微生物
12 传染与免疫
13 微生物与食品
14 微生物与农业
15 工业微生物与发酵
附录Ⅰ 名词索引
附录Ⅱ 微生物学名索引
附录Ⅲ 微生物中文名索引