《敦煌吐鲁番研究》每年出版一卷，以刊登研究敦煌吐鲁番及相关地区出土文献的论文为主，内容包括历史、地理、艺术、考古、语言、文学、哲学、宗教、政治、法律、经济、社会等各方面的传统学术问题，兼及学术动态和书评。
第十九卷刊有敦煌吐鲁番学研究者关于敦煌、吐鲁番学的最新研究成果十九篇，并刊有书评五篇，反映了敦煌学、吐鲁番学的最新研究动态。
《敦煌吐鲁番研究》为敦煌、吐鲁番学研究的专业年刊，已持续出版到第十八卷，为国际性学术期刊，以追求学风严谨、创新有据为特色，倡导发表新史料、新书评和相关学术信息，内容丰富，学术价值较高。

論文
唐蘭先生關於敦煌簡紙古籍的幾篇論文——讀《唐蘭全集》零拾
耿昇先生對敦煌學的獨特貢獻
西域發現的非漢語文書的整理與研究——以梵語藏語文獻為中心
鑄以代刻?——論敦煌寫卷刊印中木刻的使用
敦煌僧傳文學的發展與演變
敦煌寫本《佛說諸經雜緣喻因由記》校注
Q．M．62558+S．3878《維摩經義記》考辨
中古時期敦煌漢傳佛教僧團的宗派意識
英藏敦煌道教文獻拾補
敦煌寫本《百怪圖》續綴
敦煌寫本的“約定俗成”——關於中古時期寫本文化的一點思考
敦煌小說中的活俚語
道路梗澀與奏報難通——S．2589《中和四年肅州康漢君等狀》所見的信息傳遞
姓氏教材《敦煌百家姓》與晚唐五代的敦煌社會
《吐魯番出土磚誌集注》校正
日本正倉院文書中之漢籍抄寫學習史料考述
龜兹彌勒圖像以及彌勒信仰在當地的流行
1909—1910年庫車地區探險考察簡報
遼寧省博物館藏敦煌西域文獻簡目
書評
劉進寶《敦煌文書與中古社會經濟》
Brandon Dotson and Agnieszka Helman．Wazny，Codicology，Paleography，and Orthography of Early Tibetan Documents
Methods and a Case Study
Agnieszka Helman．Wainy，The Archaeology of Tibetan Books
D．Durkin．Meisteremst，The Hymns to the Living Soul．Middle Persian and Parthian Texts in the ru0Q真n Collection
《吐魯番晉唐墓地一一交河溝西、木納爾、巴達木發掘報告》
致歉聲明
新書目
《敦煌吐魯番研究》稿約
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