《全国名中医王自立临床经验集》共精选、整理王老的168则典型医案，按学科分类编辑成内科、妇儿科、五官科、外科，力求多方位、多层次、多角度地展示王自立老中医临证思辨特点和处方用药经验。

第一章 内科医案
第一节 脾系
第二节 肝系
第三节 肺系
第四节 心系
第五节 脑系
第六节 肾系
第七节 内科其他病证
第二章 妇科医案
第一节 月经病
第二节 经断前后诸证
第三节 带下病
第四节 妊娠病
第五节 产后病
第六节 乳癖
第三章 儿科医案
第四章 五官科医案
第一节 眼
第二节 鼻
第三节 耳
第四节 喉
第五章 皮肤科医案

《全国名中医王自立临床经验集》按照病证分成章节，因为老师主要从事脾胃系统疾病的诊治，故将其排在第一章。每案分为案体、按语。案体，即医案正文，包括主诉、初诊及各次复诊的望闻问切四诊资料以及理化检查结果、老师对该病证的辨证论治和组方用药、治疗结果等；按语，即对本案的讨论与评点，主要阐明老师对该病证如何取四诊资料、如何切入辨证思路、如何把握病机、如何确定治则治法、如何组方用药等，体现老师的临证经验，同时根据医案的不同情况，也会将先贤对本病或本方的见解录于案中，以便更好地说明医理。