内容推荐 本书从实用的角度出发介绍了如何解析蛋白质晶体结构。全书分为6章,主要内容包括蛋白质结晶的方法、蛋白质晶体衍射数据收集、蛋白质晶体结构解析软件的安装和使用、蛋白质晶体结构文件提交到PDB的步骤及使用软件呈现蛋白质结构的方法。本书贴近实际操作,避开了各种深层次物理原理和数学知识,更多地讲解了软件操作流程与如何根据参数指标分析蛋白质晶体解析结果,易于具有生物科学背景的研究者理解;适用于蛋白质晶体结构研究领域的初学者和具备一定实验经验的研究者。 目录 章蛋白质结晶前准备 节目的蛋白质信息检索与调查 第二节质粒制备 第三节蛋白质纯化 第四节蛋白质不表达和包涵体问题 第五节蛋白质活性鉴定 第六节蛋白质结晶前分析 第二章蛋白质结晶与衍射数据收集 节蛋白质结晶 第二节蛋白质晶体衍射数据收集 第三章蛋白质晶体结构解析软件安装 节Linux系统安装 第二节蛋白质晶体结构解析软件安装 第四章Index、integrate与scale 节一些晶体结构学知识 第二节蛋白质晶体结构解析流程 第三节Index和integrate 第四节Scale 第五节使用XSCALE功能进行scale 第六节使用HKL2000进行index、integrate和scale 第五章分子置换、构建优化与结构提交 节分子置换 第二节蛋白质晶体结构构建 第三节蛋白质晶体结构优化 第四节蛋白质晶体结构验证 第五节蛋白质晶体结构提交到PDB 第六章蛋白质晶体结构展示 节pdb格式文件简介 第二节PyMOL制作蛋白质晶体结构图 第三节使用PyMOL制作蛋白质配体结合位点的信息 第四节使用PyMOL调查蛋白质的温度因子B-factors 第五节使用PyMOL重叠对比不同的蛋白质晶体结构 第六节使用PyMOL显示蛋白质晶体结构中配体的电子密度图 第七节PyMOL结合Chimera实现同时显示非对称单元的蛋白质分子 参考文献 |