第１章绪论（１）
第１篇生物地球化学联系
第２章热带沿海生态系统的氮、磷交换（９）
第３章热带沿海生态系统的碳交换（４２）
第２篇生态联系
第４章珊瑚礁鱼类与甲壳纲十足类产卵聚集的动力学研究：潜在机制、生境连通性和营养关系（６７）
第５章海洋鱼类和甲壳纲十足类幼体寻找热带沿海生态系统的感官和环境线索（１３２）
第６章影响热带沿海生态系统鱼类和十足类补充模式的机制（１７９）
第７章热带沿海生态系统连通性———以十足类的生境转换为例（２２１）
第８章连通热带沿海生态系统的鱼类和十足类昼夜与乘潮洄游（２５９）
第９章生活在两个世界：热带河流和海岸之间的海河洄游性鱼类及影响其种群连通性的因素（３１１）
第１０章红树林和海草床作为热带十足类和珊瑚礁鱼类育幼场功能评价：模式及其作用机制（３４０）
第１１章影响红树林育幼功能认知差异的根源（３８５）
第３篇研究生态和生物地球化学联系的方法
第１２章热带沿海生态系统间生物地球化学连通性研究方法（４０７）
第１３章研究海洋生态系统生物相互作用的工具———天然标志和人工标志（４３７）
第１４章采用景观生态学方法研究热带海洋景观生态连通性（４７０）
第４篇管理和社会经济影响
第１５章热带沿海生境和（近海）渔业的关系（５０７）
第１６章热带沿海生态系统的保护和管理（５３７）
索引（５７４）

该书的出版传播可为热带沿海资源和发展的决策者与管理者带来这样必要的意识，即不仅要保护生境和物种，也要通过维持这些沿海生态系统之间高水平的相互作用来实现生态系统服务和资源的可持续发展。