苏巴什佛寺遗址是新疆地区乃至全国保留至今规模优选、保存较完整、历史很悠久的古代佛寺遗址,反映了丝绸之路上的古龟兹地区长期作为西域佛教传播中心的历史。
西寺石窟共计14座,在形制上结合了印度塔堂窟与僧房窟的特点,从而创造出古龟兹特有的新窟形,并对龟兹以东地区的禅窟形制产生了重要影响。西寺石窟形制以禅窟为主,反映了古龟兹在佛教信仰上曾经以重禅观的小乘佛教为主。壁画题材以树下结跏趺坐、站立的僧侣像为主,也有个别的本生故事。大量僧侣形象的绘制,体现了古龟兹地区的佛教信仰以追求自我解脱的小乘佛教为主的特点。西寺石窟的形制在晚期阶段发生了改变,可能与唐王朝对西域的经营有密切关系。同时,从西寺石窟吸收古印度的石窟形制等方面的因素来看,也反映了古龟兹地区曾是“丝绸之路”上的重要通道。
东寺虽仅存3座石窟,但其题材多样,内涵丰富。石窟形制也以禅窟为主,体现了古龟兹在佛教信仰上曾经以重禅观的小乘佛教为主。千佛像则反映了随着唐王朝对西域的经营,大乘佛教也传播到了这里,从而在唐代及其以后,古龟兹地区出现了小乘与大乘佛教信仰混杂的局面。