《针灸甲乙经》全书 12卷，共 128篇。其内容大致为：卷一论脏腑、气血津液，卷二论经络，卷三论腧穴，卷四论脉诊，卷五论刺灸法，卷六论病因病机，卷七至卷十二论临床各科疾病的针灸治疗。全书按基础理论、经络腧穴、诊断、刺灸操作、临床治疗的次序编排，系统而有条理。适合针灸工作者、中医工作者及中医爱好者参考阅读。

卷一
精神五脏论
五脏变腧第二
五脏六腑阴阳表里第三
五脏六腑官第四
五脏大小六腑应候第五
十二原第六
十二经水第七
四海第八
气息周身五十营四时日分漏刻第九
营气第十
营卫三焦第十一
阴阳清浊精气津液血脉第十二
津液五别第十三
奇邪血络第十四
五色第十五
阴阳二十五人形性血气不同第十六
卷二
十二经脉络脉支别（上）
十二经脉络脉支别（下）
奇经八脉第二
脉度第三
十二经标本第四
经脉根结第五
经筋第六
骨度肠度肠胃所受第七
卷三
头直鼻中发际旁行至头维凡七穴
头直鼻中入发际一寸循督脉却行至风府凡八穴第二
头直侠督脉各一寸五分却行至玉枕凡十穴第三
头直目上入发际五分却行至脑空凡十穴第四
……
卷四
卷五
卷六
卷七
卷八
卷九
卷十
卷十一
卷十二