本书主要介绍了细菌、古生菌等原核生物，酵母菌、霉菌、蕈菌等真核微生物，以及无细胞结构生物病毒的系统进化和主要类群，叙述了微生物的代谢、遗传育种、生态和分类鉴定等的很近研究成果，并介绍了微生物在食品、医药、环保、能源和农业等领域中的应用，反映了组学时代微生物学研究与应用的新进展。在本科普通微生物学的基础上，进一步就微生物学基础理论、研究技术等方面进行强化和拓展。本书有20个专题，既有比较基础的显微技术、古生菌等，也有组学技术应用、噬病毒体、病毒生态学、细菌物种形成等较新内容，微生物在烟草工业中的应用等内容为靠前首先成为专题。

何培新，男，郑州轻工业学院系主任，教授。主要作品《香菇标准化生产》《茶薪菇高效栽培技术》《食用菌栽培学》。

1绪论
1.1技术创新直接促进了微生物学的发展与进步
1.2微生物学研究技术
1.3“组学”时代的微生物学
2原核生物
2.1原核生物的分类与系统学
2.2细菌
2.3古生菌
2.4极端微生物
3真核微生物
3.1真核微生物的分类与系统发育
3.2酵母菌
3.3霉菌
3.4蕈菌
4无细胞结构生物——病毒
4.1概述
4.2噬病毒体
4.3病毒生态学
4.4新生病毒
5微生物的代谢
5.1微生物的代谢体系
5.2代谢途径的调控
5.3代谢流分析
6微生物的遗传与育种
6.1微生物基因组学
6.2分子定向进化育种
6.3基因组定点编辑技术
7现代微生物生态学
7.1现代微生物生态学的研究方法
7.2微生物的多样性与微生物资源利用
7.3微生物与生物地球化学循环
7.4组学时代的微生物生态学
8微生物的分类与鉴定
8.1细菌种与物种形成
8.2微生物分子鉴定技术
8.3细菌鉴定实例
8.4放线菌鉴定实例
8.5酵母菌鉴定实例
8.6真菌的分类与鉴定
9微生物与食品
9.1微生物与传统发酵食品
9.2食品微生物快速检测技术
9.3组学技术在食品安全中的应用
9.4宏基因组学在食品工业中的应用
10微生物与医药
10.1抗生素
10.2萜类化合物
10.3甾体类化合物
10.4微生物多糖
10.5黄酮类化合物
10.6生物活性肽
10.7微生物产生的酶及酶抑制剂
11微生物与环境保护
11.1环境微生物监测技术
11.2微生物与水污染
11.3微生物与大气污染
11.4微生物对环境污染物的降解
11.5微生物修复技术
12微生物与能源
12.1生物质预处理及水解微生物
12.2微生物与燃料乙醇
12.3微生物与生物柴油
12.4微生物与沼气发酵
12.5微生物与生物制氢
12.6微生物燃料电池
13微生物与农业
13.1微生物农药
13.2微生物肥料
13.3微生物饲料