此书摘录《本草纲目》中本经药233味，(另有附品56种)，作“崇原”之论，自序云“诠释《本经》阐明药性，端本五运六气之理，解释详备，”有探讨药性理论之意，药分上中下三品，从药物性味、生成、阴阳五行属性、形色等入手，结合主治疾病之机理，阐明功效，崇本求原思想，对徐大椿、陈修园等影响颇大。

卷上本经上品
人参1
甘草2
黄芪2
白术3
苍术附5
薯蓣5
石斛6
酸枣仁7
大枣8
芡实8
莲实9
莲花附10
莲蕊须附10
莲房附10
莲薏附10
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