内容推荐 鲁道夫·巴兰古,约翰·范德奥斯特主编的《CRISPR-Cas--RNA介导的细菌和古细菌中适应性免疫系统》对近年来发现的存在于细菌和古细菌中的适应性免疫系统-CRISPR系统进行了全视角系统阐释。描述了CRISPR-Cas系统的整体变异性、多样性特征,以及利用这种变异性描绘菌种之间的系统发育关系。通过对CRISPR-Cas系统中cas基因组进行比较分析,提供了不同CRISPR-Cas类型(Ⅰ,Ⅱ和Ⅲ型)的级联复合物结构的精细模型。讨论了基于CRISPR免疫应答的调控机制和CRISPR-Cas系统防御侵袭基因组关键要素crRNA的生物合成机制。阐释了CRISPR-Cas的细菌细胞毒性作用以及在不同工业和生物技术、基因组编辑等领域的多种应用。最后阐明了CRISPR作用机制的分子基础和微生物群落背景下的CRISPRs系统。 本书适合生命科学、医学、环境科学、食品加工、农业和畜牧(渔)业等相关专业领域的人士阅读,特别是对应用CRISPR-Cas9基因组编辑技术的相关科研领域的研究人员有极高的参考价值。 目录 序 原著前言 第1章 CRISPR的发现和重要发展 1.1 概述 1.2 早期突破 1.2.1 规律间隔重复序列 1.2.2 分枝杆菌中的同向重复序列 1.2.3 嗜盐古菌中的TREPs 1.2.4 原核微生物重复序列新家族 1.2.5 古细菌和细菌中CRISPR序列的分布 1.2.6 加工的CRISPR转录物的发现 1.2.7 CRISPR相关蛋白的鉴定 1.3 CRISPR-Cas系统的功能 1.3.1 早期假设 1.3.2 CRISPR与入侵遗传元件的关系 1.3.3 CRISPR系统的功能多样性 1.4 基于CRISPR系统的功能元件 1.4.1 CRISPR相关蛋白(Cas) 1.4.2 CRISPR序列 1.4.3 前导区 1.4.4 重复序列 1.4.5 间隔序列 1.4.6 前间隔区毗邻基序 1.4.7 CRISPRRNAs 1.5 反馈 第2章 CRISPR-Cas系统的形成、多样性和基因分型意义 2.1 概述 2.2 评估CRISPRs的整体多样性 2.2.1 生物信息学工具 2.2.2 在已公布的基因组中发现的CRISPRs多样性 2.3 CRISPRs多态性用于基因分型的历史案例 2.3.1 为什么需要以及如何进行种内分型 2.3.2 种内CRISPR变异 2.3.3 复杂微生物组中CRISPR多样性的后续研究 2.4 讨论 第3章 CRISPR-Cas系统的进化与分类和Cas蛋白家族 3.1 概述 3.2 CRISPR-Cas系统的分类 3.3 Cas蛋白家族 3.3.1 Cas 1和Cas 2:在间隔区获得中发挥作用的Cas特征蛋白 3.3.2 HD结构域:干扰所需的单链特异性DNAse 3.3.3 级联相关性蛋白 3.3.4 RAMPs的三大家族 3.3.5 CRISPR-Cas操纵子中RAMP基因的特征性排列 3.3.6 各种Ⅰ型和Ⅲ型CRISPR-Cas系统的大小亚基之间推测的同源性 3.3.7 Ⅱ型CRISPR-Cas系统和Cas9同源物 3.3.8 关于CRISPR-Cas系统起源和进化的假设 3.3.9 结论 第4章 基于CRISPR的免疫应答调控 第5章 crRNA的生物合成 第6章 Ⅰ型CRISPR-Cas系统的分布与机制 第7章 Ⅱ型CRISPR-Cas系统的生物与遗传特性 第8章 Ⅲ型CRISPR-Cas系统和CRISPR-Cas的细菌毒性作用 第9章 应用CRISPR-Cas系统研究生态多样性和宿主-病毒相互作用 第10章 CRISPR在生理过程调控中的作用 第11章 多功能CRISPR-Cas系统的应用 第12章 微生物群落背景下的CRISPRs 术语词汇表 索引 后记
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