吉林省扶余市档案馆藏有清代伯都讷副都统衙门及伯都讷旗务承办处满、汉文档案。档案起止时间为清同治六年（1867）至宣统三年（1911），总量约为5000多卷，30000余件。其中，满文或满汉合璧档案约100件，其余为汉文档案。
吴忠良、赵洪祥主编的《清代伯都讷满汉文档案选辑(上下)(精)》所选档案主要为满文或满汉合璧档，以及与其内容关联密切的少数汉文档，以伯都讷副都统衙门或伯都讷旗务承办处，与吉林将军衙门或吉林全省旗务处、以及及其辖下各机构间往来的公文书为主。其内容主要涉及到了军事、官制、人事、财政、旗人生计、民人管理、教育等方面的问题。

《上册》
第一编
1 伯都讷副都统衙门为发给天主堂承领捕鱼执照事咨天主堂文 光绪三十一年十一月二十二日
2 伯都讷副都统衙门为报送拣选兵花名清册事呈吉林将军衙门文 光绪三十二年三月十一日
3 伯都讷副都统衙门为派员将常备军逃回之兵送营事咨吉林常备军二标统带文 光绪三十二年十月八日
4 伯都讷副都统为查复常备军兵人数事札饬左右两翼协领文 光绪三十二年十二月二十四日
5 伯都讷副都统为严孥常备军逃兵事札饬左右两翼协领文 光绪三十三年五月一日
6 伯都讷副都统为报送常备军花名清册事呈吉林巡抚文 光绪三十三年十月十五日
7 伯都讷副都统为教习瑚图礼已三年期满事呈吉林巡抚文 光绪三十三年十一月十五日
8 伯都讷副都统为严缉潜逃之常备军披甲金升等事札饬左右两翼协领文 光绪三十四年二月一日
9 伯都讷副都统为严缉常备军逃兵富林等事札饬左右两翼协领文 光绪三十四年七月二十五日
10 伯都讷副都统为报送拣选之兵花名清册事行吉林全省旗务处文 光绪三十四年八月四日
11 伯都讷副都统为严缉常备军逃兵事札饬左翼协领文 光绪三十四年八月十日
12 伯都讷副都统为报送义仓公田地亩事呈东i省总督吉林巡抚文 宣统元年二月十二日
13 伯都讷副都统为勘明绘图义仓公田地亩事札饬特派云骑尉托璋阿文 宣统元年四月一日
14 云骑尉托璋阿等为勘丈义仓公田地亩清册绘图事呈伯都讷副都统文 宣统元年五月三日
15 伯都讷副都统为将挑妥之兵交付来员启程赴营送讫事咨吉林全省旗务处文 宣统元年六月七日
16 伯都讷副都统为将挑妥之兵交付来员领回本营事咨复吉林全省旗务处文 宣统元年十月十四日
……
《下册》