《药师经》主要叙说药师如来之本愿及其功德，在佛教信众中影响很大。《药师经讲记》为释印顺(印顺法师)1954年在台北善导寺讲说此经的文字记录，深入浅出，透彻明了，为研读此经之津梁。本书内容包括悬论，叙缘起，释经题，明翻译，正释，缘起分，叙事证信，礼请起说，正宗分，如来开示，依正行愿，总标依正，别陈行愿，戊行愿，己总说，己别叙，庚生佛平等愿，庚开晓事业愿，庚无尽资生愿等等。

悬论

 一 叙缘起

 二 释经题

 三 明翻译

正释

 甲一 缘起分

 乙一 叙事证信

 乙二 礼请起说

 甲二 正宗分

 乙一 如来开示

 丙一 依正行愿

 丁一 总标依正

 丁二 别陈行愿

 戊一 行愿

 己一 总说

 己二 别叙

 庚一 生佛平等愿

 庚二 开晓事业愿

 庚三 无尽资生愿

 庚四 安立大道愿

 庚五 戒行清净愿

 庚六 诸根具足愿

 庚七 身心康乐愿

 庚八 转女成男愿

 庚九 回邪归正愿

 庚十 从缚得脱愿

 庚十一 得妙饮食愿

 庚十二 得妙衣具愿

 己三 总结

 戊二 果德

 己一 说略指广

 己二 以西喻东

 己三 以伴赞主

 丁三 结劝往生

 丙二 善巧方便

 丁一 闻名忆念益

 戊一 离恶益

 己一 离悭吝贪惜恶

 己二 离毁犯见慢恶

 己三 离嫉妒诽谤恶

 己四 离斗讼咒诅恶

 戊二 得善益

 己一 得往生净土益

 己二 得上生天国益

 己三 得还生人间益

 己四 得转生丈夫益

 丁二 持咒治病益

 戊一 由愿观苦

 戊二 人定说咒

 戊三 持咒灭苦

 戊四 结劝受持

 丁三 供养受持益

 戊一 供养得护持益

 己一 修供养行

 己二 得护持益

 庚一 曼殊护持

 庚二 诸天护持

 戊二 受持得加被益

 己一 受持仪轨

 己二 受持效益

 庚一 获福益

 庚二 免难益

 辛一 百怪出现难

 辛二 一切怖畏难

 辛三 内乱外患难

 辛四 毁犯堕落难

 辛五 女人生产难

 丙三 德行叵思

 丁一 信解难得

 戊一 问答决定

 戊二 信谤德失

 戊三 信解希有

 丁二 功德无尽

 乙二 菩萨弘传

 丙一 开示弘通

 丁一 救病难以延命

 戊一 说延寿法

 己一 起说

 己二 正明

 庚一 病患垂危

 庚二 神识受报

 庚三 作福续命

 庚四 励力行善

 己三 结劝

 戊二 明延寿仪

 己一 问

 己二 答

 了二 救国难以延命

 了三 救众难以延命

 丙二 问答释疑

 丙三 结劝修度

 乙三 药叉誓护

 甲三 流通分

 乙一 阿难问名

 乙二 大众奉行