中国的改革，在顶层设计之外，还必须有顶层理论、顶层思想的支持。十八届三中全会通过的《中其中央关于全面深化改革若干重大问题的决定》，深刻剖析了我国改革发展稳定面临的重大理论和实践问题，阐明了全面深化改革的重大意义和未来方向，提出了全面深化改革的指导思想、目标任务、重大原则，描绘了全面深化改革的新蓝图、新愿景、新目标，合理布局了深化改革的战略重点、优先顺序、主攻方向、工作机制、推进方式和时间表、路线图，汇集了全面深化改革的新思想、新论断、新举措，形成了改革理论和政策的一系列重大突破，是我们党在新的历史起点上全面深化改革的科学指南和行动纲领。
2013年11月14日，中共中央党校举行2013年秋季学期第二批进修班开学典礼。中央政治局常委、中央党校校长刘云山出席并讲话。他强调，党的十八届三中全会把握时代实践和人民的新要求，在新的历史起点上全面深化改革做出战略部署，在理论上有一系列重大创新，在政策上有一系列重大突破，充分体现了以习近平同志为总书记的党中央高举改革开放旗帜的高度自觉。这种自觉来自对35年改革开放成功经验的深刻总结，来自对我国基本国情和形势变化的清醒认识，来自对中国特色社会主义的坚定自信。
改革开放是决定当代中国命运的关键抉择。解读十八届三中全会公报可以看到，经过30多年的探索，中国改革形成了自己的特点：顶层设计与基层探索相统一、微量积累与重点突破相统一、宏阔视野与具体设计相统一、延续l！生与创新性相统一、整体性与针对性相统一。这些“统一”，将“改革”提高到历史唯物主义高度，并首次定义了市场在资源配置中的“决定性作用”、提出了“发挥经济体制改革牵引作用”、在“解放思想”“解放和发展社会生产力”之外加上了“解放和增强社会活力”、强调了“推进国家治理体系与治理能力现代化”。它将“市场经济”“民主政治”“文化强国”“和谐社会”和“美丽中国”的普遍诉求，落实为具体的改革设计，为未来相当长一个时期内的改革实践提出了总体部署。国务院发展研究中心研究员吴敬琏认为，这次全会是以经济体制改革为重点。但从全会公报看，对配套的政治体制改革已经进行了部署，其中很多内容对打破特殊既得利益藩篱、切实深化改革具有重要意义。比如，全会要求“加快推进社会主义民主政治制度化、规范化、程序化，建设社会主义法治国家，发展更加广泛、更加充分、更加健全的人民民主”；“让人民监督权力，让权力在阳光下运行”；“加强社会主义民主政治制度建设，推进法治中国建设，强化权力运行制约和监督体系”，等等。这些方面都是有利于抑制各级政府力图掌控市场的过度干预活动，都有利于理顺政府和市场的关系，有利于经济体制改革的全面推进。
十八届三中全会公报提出全面深化改革的总目标是完善和发展中国特色社会主义制度，推进国家治理体系和治理能力现代化。国家治理体系和治理能力现代化的提法在党的全会正式文件中是首次出现，体现了党的话语体系发生了变化，有了创新，进一步与国际接轨。国家治理体系和治理能力现代化的基本如果说十一届三中全会开创了中国改革的第一季，那么十八届三中全会将为中国改革第二季勾画宏伟蓝图。公报全文多次用到“治理”这个词，从“管理”到“治理”一词之变，体现了中国其产党执政理念的根本转变。“管理”变成“治理”，最核心的变化是治理主体的多元化。在社会主义市场经济体系下，我们完成了从“单位人”向“社会人”的身份的转变。在这种情况下，需要多元化的社会治理，正式的提法是——“党委领导、政府负责、社会协同”。过去我们讲摸着石头过河，现在的改革既要摸着石头过河，又要搞顶层设计。顶层设计就是要统筹规划、通盘考虑，加强各方面的协调。改革进入深水区，矛盾盘根错节，要解决复杂问题，需要协调推进，中央成立全面深化改革领导小组恰逢其时。三中全会不仅总体部署，提出系列改革任务，而且注重在落实方面下功夫。成立全面深化改革领导小组是一个组织保障。提出任务、提出目标，得有一个机构去抓落实、去领导，组织保障非常关键。不仅如此，全会要求，要加强和改善党领导改革开放的能力。紧紧围绕提高党科学执政、民主执政、依法执政的水平这一主题来全面推进党的建设新的伟大工程，确保党领导改革的能力与改革目标相适应。P28-30