石美森编著的《生物学证据研究与应用》主要内容源自于2000～2012年2月，大约12年期间发表的有关法医物证学研究报告、论文和会议文献以及部分主流商业公司和相关的法医物证学网站提供的共享资源。检索工具包括PUBMED、EMBase、ScienceDi-reet、中国知网、维普、万方、学术Google等，所列参考文献800余篇，主要以外文为主。涵盖生物学证据的筛查与采集、STR技术、mtDNA、SNP、InDel、自动化系统与软件研发、灾害事故处理、RNA分析等主要领域，每一部分也有重点推荐读者阅读的综述类文献。

第一章 生物学证据的筛查和采集

 第一节 前言

 第二节 生物学证据筛查技术

一、各种生物学证据的物质组成

二、血液(痕)筛查

三、精液(斑)筛查

四、唾液(斑)筛查

五、其他生物学证据的筛查

六、分子生物学技术在生物学证据筛查检测中的应用

七、光学技术在生物学证据筛查检测中的应用

 第三节 生物学证据的采集

 第四节 小结

 参考文献

第二章 短串联重复序列(STR)及其相关技术

 第一节 前言

一、短串联重复序列(STR)

二、Y染色体

三、X染色体

 第二节 STR分析技术

一、DNA的提取与定量

二、电泳技术

 第三节 常用sTR遗传标记和商品化试剂盒

一、常染色体STR位点选择与复合扩增试剂盒

二、CODIS系统与DNA数据库

三、STR位点遗传信息

四、sTR位点的群体变异和突变

五、sTR位点的群体遗传学研究

六、sTR分型结果的解释

七、亲缘关系分析(Kinship Analysis)

 第四节 miniSTR分型技术

一、生物学证据的腐败降解与STR分型的影响

二、miniSq、R技术研究

三、miniSTR试剂盒的研发与复合扩增体系构建

 第五节 Y染色体sTR

一、Y—STR的法医学应用

二、Y—STR与人类迁徙

三、Y—STR与家族姓氏-

 第六节 x染色体STR

一、x—STR位点选择与重组现象

二、x—sTR的复合扩增体系构建与试剂盒

三、x—STR的连锁与重组研究

 第七节 小结

 参考文献

第三章 线粒体DNA(mtDNA)分型技术

 第一节 前言

一、线粒体DNA(mtDNA)

二、毛发样本

 第二节 mtDNA分析技术

一、mtDNA的提取与定量

二、mtDNA的PCR扩增

三、mtDNA的序列分析

四、mtDNA分析的影响因素研究

 第三节 mtDNA的法医学应用

一、种属鉴定

二、线粒体异质性研究

三、线粒体编码区多态性研究

四、mtDNA数据库与群体学研究

五、mtDNA在动物鉴定中的应用

 第四节 小结

 参考文献

第四章 单核苷酸多态性(SNP)

 第一节 前言

 第二节 SNP分析技术

一、SNP遗传标记在法医物证学中的应用地位

二、SNP位点选择与检测系统构建

三、SNP分析技术

四、SNP数据库

五、SNP的法医学应用

 第三节 小结

 参考文献

第五章 INDEL遗传标记

 第一节 前言

一、遗传标记

二、InDel遗传标记分类及其特点

 第二节 小片段InDel位点与法医学应用

一、InDel的研究发展阶段

二、InDel遗传标记的法医学研究与应用

三、InDel遗传标记与人类群体基因结构、进化相关研究

 第三节 SINE转座子与法医学应用

一、转座子与Alu重复元件(Alu repeat element)

二、SINE转座子的法医学应用

 第四节 小结

 参考文献

第六章 低拷贝生物学证据(LCN)分析策略

 第一节 前言

 第二节 LCN的采集与分析

一、LCN样本的采集

二、LCN DNA的扩增和检测

 第三节 LcN证据分型结果的解释

一、针对LcN证据分型结果的解释策略

二、微量混合斑证据的解释策略

 第四节 LCN证据分析中的相关问题研究

一、污染问题

二、转移问题

 第五节 小结

 参考文献

第七章 生物学证据分析处理的自动化平台

 第一节 前言

 第二节 生物学证据DNA的自动化提取

一、低通量的自动化提取平台

二、高通量的自动化提取平台

 第三节 生物学证据DNA的自动化检测与分析

 第四节 小结

 参考文献

第八章 生物学DNA证据解释的相关软件

 第一节 前言

 第二节 生物学证据DNA sTR分型解释软件

一、依据概率理论解释分型结果

二、依据STR分型特征解释分型结果

三、STR分型结果评估软件

四、验证性研究相关软件

 第三节 小结

 参考文献

第九章 生物学证据检测与分析新技术

 第一节 前言

 第二节 生物学证据的自动化扫描

 第三节 生物学证据的微分析技术

一、生物学证据DNA的分离和提取

二、生物学证据DNA的扩增和分型

 第四节 小结

 参考文献

第十章 大型灾难事件中的个体识别

 第一节 前言

 第二节 灾难事件处理的管理

 第三节 生物学样本的采集和保存

 第四节 DNA的检测与分型

 第五节 生物信息学数据分析中的相关问题研究

 第六节 既往事件处理中的经验总结

 第七节 小结

 参考文献

第十一章 RNA分析技术

 第一节 前言

一、RNA介绍

二、mRNA介绍

三、miRNA介绍

 第二节 mRNA分析技术

一、样本采集、提取和质量评估

二、RNA的逆转录

三、mRNA分析的标准化质量控制

四、数据解释

 第三节 mRNA的法医学应用

一、mRNA稳定性研究

二、mRNA的体液斑鉴别研究

 第四节 mRNA分析应用中的相关问题

 第五节 miRNA的生物学功能

一、miRNA的生物合成

二、miRNA的调节与分型

 第六节 miRNA检测技术

 第七节 miRNA在生物学证据分析中的应用

 第八节 小结

 参考文献

附录1 中英文缩写对照表

附录2 生物学证据分析相关主要国际组织介绍