《DNA计算中的编码方法》编著者朱翔鸥等

DNA计算的基本原理是：以编码生命信息的遗传物质——DNA序列作为信息编码的载体，利用DNA分子的双螺旋结构和碱基互补配对的性质，将所要处理的问题映射为特定的DNA分子；然后在生物酶的作用下，通过可控的生化反应生成问题的解空间；最后利用各种现代分子生物技术如聚合酶链反应PcR、聚合重叠放大技术POA、超声波降解、亲和层析、分子纯化、电泳、磁珠分离等手段获取运算结果。

《DNA计算中的编码方法》编著者朱翔鸥等。

《DNA计算中的编码方法》内容提要：编码问题是DNA计算中的基本问题，也是关键问题。在DNA计算模型中，数据通过DNA编码表示，数据计算和处理通过DNA分子间的特异性杂交来完成，DNA编码质量直接影响DNA计算的精确度。本书介绍了DNA计算模型和应用，阐述了DNA计算的编码问题，针对编码方法展开讨论，研究了线性编码方法以及构造和计数问题，研究了模板、模板框和单模板等编码方法，最后建立了DNA解链温度的预测模型。

本书适合从事DNA计算及相关领域的科研人员参考，也可以供高校、科研机构的研究生学习参考。

第1章 DNA计算的概述

1.1 引言

1.2 DNA计算模型

1.2.1 基于非线性分子结构的计算模型

1.2.2 DNA进化算法

1.3 基于DNA的布尔电路模拟

1.4 基于DNA的大规模数据库

1.5 在生物信息处理方面的应用

1.6 编码问题的研究

1.7 小结

第2章 DNA计算中的编码问题

2.1 引言

2.2 编码问题及其影响因素

2.3 编码方法

2.4 编码的计数问题

2.5 小结

第3章 线性编码方法

3.1 引言

3.2 DNA计算的编码的约束条件

3.3 编码的构造

3.4 算法

3.5 热力学性质

3.6 小结

第4章 构造DNA计算的线性编码

4.1 引言

4.2 线性编码的模运算

4.3 构造线性编码

4.4 编码的存在性

4.5 编码的存在性结果

4.6 小结

第5章 DNA计算线性编码的计数方法

5.1 引言

5.2 DNA计算线性编码的算法

5.2.1 独立约束

5.2.2 组合约束的搜索算法 

5.3 组合约束的计数

5.4 小结

第6章 模板编码方法

6.1 引言

6.2 编码的搜索

6.3 结果讨论

6.4 模板集合的优化

6.4.1 算法

6.4.2 结果分析

6.5 编码的稳定性

6.6 小结

第7章 模板框

7.1 引言

7.2 模板框的概念

7.3 算法与结果

7.3.1 算法步骤

7.3.2 双边词模板框 

7.3.3 单词标模板框

7.4 模板框的应用

7.5小 结

第8章 单模板编码方法

8.1 引言

8.2 单模板编码方法及其数学理论

8.3 算法及结果

8.3.1 模板框的算法

8.3.2 计算结果

8.4 应用

8.5 小结

第9章 基于BP神经网络的DNA解链温度(L)的预测模型

9.1 引言

9.2 解链温度的定义及计算方法

9.2.1 解链温度瓦  

9.2.2 邻近法模型  

9.3 神经网络模型

9.4 结果分析

9.5 小结

参考文献