分子系统发生学是应用分子数据重建系统发生关系的学科。由于系统发生关系已经成为整合包括生物多样性在内的生物学知识的基本框架，所以构建生物类群之间的系统发生关系成为当代生物学的基本研究方法。《分子系统发生学(精)》由黄原编著，本书全面系统地论述了分子系统发生学的基础、原理、方法及应用。

《分子系统发生学(精)》由黄原编著，分子系统发生学是应用分子数据重建系统发生关系的学科。本书全面系统地论述了分子系统发生学的基础、原理、方法及应用。全书由18章组成，可以归纳为五大部分：第一部分包括第1～3章，分别介绍了系统发生和系统树的基本知识；第二部分包括第4～7章，是分子系统发生分析的基础，其中第4章和第5章是分子系统发生学的信息学基础，第6章是数据集系统发生信号评估，第7章讨论了分子进化模型及模型选择原理与方法；第三部分中的第8～12章是各种系统发生分析方法，分别就目前主要的系统发生分析方法(距离矩阵法、简约法、最大似然法、贝叶斯推论法和系统发生网络法等)从原理、软件操作、应用及局限性等方面进行了详细的介绍，第13章讨论了系统发生假设检验的原理和方法。第14章讨论了系统发生分析可靠性与影响因素；第四部分主要涉及各类数据集分析策略，其中第15章总结了不同类型数据的分析策略，第16章对复杂数据系统发生的分析策略与方法进行了详细地介绍，第17章是多基因数据分析策略和方法；最后一部分即第18章是系统树的可视化、注释与应用方面的内容。

《分子系统发生学(精)》可作为生物学、生物技术、生态学和生物信息学专业的本科生、研究生及科研人员学习分子系统发生学的教材或参考资料。

前言

第1章 系统发生学概论

第2章 系统发生分析基础

第3章 系统树

第4章 系统发生信息学

第5章 数据集准备与序列比对

第6章 数据集系统发生信号评估

第7章 进化模型及其选择

第8章 距离矩阵方法

第9章 简约法

第10章 最大似然法

第11章 贝叶斯系统发生推论法

第12章 系统发生网络、超树和无比对方法

第13章 系统发生假设检验

第14章 系统发生分析的可靠性与影响因素

第15章 不同类型数据的分析策略

第16章 复杂数据和困难系统发生的分析策略与方法

第17章 多源数据集分析策略和方法

第18章 系统树的可视化、注释与应用

参考文献