《micro RNA鉴定与功能分析技术/生物实验室系列》由刘长征、余佳编著,包括四部分,分为microRNA基本知识概述、生物信息学研究方法、分子生物学研究方法以及相应方法的实际应用等。在概述部分,主要介绍microRNA的发现历程及生物起源,microRNA的特征及鉴别分析,microRNA的调控机理与生物功能以及几种常见非编码RNA的异同等。在生物信息学研究方法部分,主要介绍了目前microRNA研究常用的几种在线生物信息学分析软件,而在分子生物学研究方法部分则介绍了十余种有关microRNA克隆、表达分析、表达干预及分子机制研究等方法,并将microRNA预测的生物信息学方法、靶基因预测的分子生物学方法与相应的分子生物学方法综合介绍,使之更为系统。最后,编者根据自己的研究经历,通过阐述microRNA一21在肝细胞癌发生过程中的功能,系统介绍了microRNA相关方法的实际应用。通过上述安排,读者在了解microRNA基本概念的同时,可以系统学习microRNA的研究方法并将其应用于自己的研究工作中。
《micro RNA鉴定与功能分析技术/生物实验室系列》由刘长征、余佳编著,综合国内外有关microRNA研究的进展,首先介绍了microRNA的发现历程、生物起源及加工成熟的机制、特征及鉴别等,然后在阐述microRNA作用机制的基础上,详细介绍了microRNA的调控机理及其在生理、病理进程中的功能,并着重探讨了几种主要非编码RNA的区别。随后,重点介绍microRNA的研究方法,涉及生物信息学分析方法与分子生物学方法,前者包括microRNA相关的数据库及序列信息获取、microRNA基因簇的分析策略、种系发育分析策略以及microRNA的转录调控等;后者则包括新microRNA基因的探索与克隆、microRNA的表达分析方法、microRNA表达干预方法以及功能研究策略等。最后编者根据自己的工作实践,系统介绍了microRNA相关研究方法在肝细胞癌研究中的应用。
《micro RNA鉴定与功能分析技术/生物实验室系列》具有理论结合实际、系统性强等特点,由子取材新颖、图文并茂,对从事microRNA研究同行具有较高的参考价值,适合从事生命科学研究的科研人员及高等院校师生阅读。
第一章 概述
第一节 microRNA的发现历程
第二节 microRNA的起源与加工成熟
第三节 microRNA 的特征和鉴别
第四节 microRNA 的调控机理
第五节 microRNA 的功能
第六节 microRNA、siRNA、piRNA及其他非编码RNA
参考文献
第二章 microRNA的生物信息学研究方法
第一节 microRNA的生物信息学分析策略概述
第二节 microRNA序列信息的获取及相关数据库的建立
第三节 microRNA簇的分析策略
第四节 microRNA的种系发育分析
第五节 microRNA基因的转录调控分析
参考文献
第三章 microRNA的分子生物学研究方法
第一节 microRNA表达分析方法
第二节 microRNA体外或体内水平的过表达研究
第三节 microRNA表达抑制研究
第四节 体外验证microRNA作用的靶基因
第五节 microRNA功能研究的策略
参考文献
第四章 microRNA新基因的预测、克隆鉴定及注册
第一节 microRNA新基因的预测及注册程序
第二节 microRNA新基因的克隆及鉴定方法
参考文献
第五章 microRNA表达分析方法
第一节 microRNA基因芯片分析
第二节 microRNA PAGE/Northern Blot分析
第三节 microRNA的实时定量PCR检测
第四节 microRNA LNA-ISH 原位杂交
参考文献
第六章 microRNA 表达的干预方法——过表达
第一节 化学合成的microRNA mimics
第二节 真核系统过表达——非病毒载体瞬时表达载体的构建
第三节 microRNA腺病毒过表达系统
第四节 microRNA的慢病毒过表达系统
参考文献
第七章 microRNA表达的干预方法——表达抑制
第一节 反义核酸分子的抑制策略——化学合成的microRNA抑制剂
第二节 基因水平的抑制策略
第三节 基于病毒表达系统的microRNA抑制策略
参考文献
第八章 靶基因预测分析及萤光素酶双报告基因系统验证
第一节 生物信息学预测——microRNA靶基因分析软件的设计及使用
第二节 萤光素酶双报告基因系统的应用
参考文献
第九章 microRNA研究方法在肝细胞癌研究中的应用
第一节 microRNA-21在肝细胞癌中的功能研究简介
第二节 microRNA-21在肝细胞癌中的功能研究所用实验材料与方法
第三节 miR-21在肝细胞癌发生过程中的表达分析及功能研究
第四节 miR-21在肝细胞癌发生及发展过程中的作用机制研究
第五节 miR-21通过调控不同的靶基因在肝细胞癌发生过程中所发挥的功能研究
第六节 miR-21对重要信号通路及功能基因的影响
第七节 microRNA在肿瘤研究中的分析与展望
参考文献