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编辑推荐 克雷格·文特尔著的《生命的未来(从双螺旋到合成生命)(精)》是一本详细论述生命科学的基本原理的杰出著作,全景展示了分子生物学的历史沿革和未来发展方向。更重要的是,读者可以从中了解当今科学跨学科的融合:物理、化学、生物学以及天文学之间密不可分的关系。 21世纪,是生命科学大发展的时代,下一次科技产业革命必将发生在生命科学领域!人类正在经历一个重大转折点,本书讲述的就是“奇点”到来之时DNA信息和计算机如何有机结合的有趣故事,不但震撼力十足,也极具说服力。人类进化一旦经过“奇点”,生命、社会以及我们关心的一切,都可能有令人震惊的事情发生。 中国科学院北京基因组研究所研究员、中国科学院精准基因组医学重点实验室主任曾长青、著名科幻小说作家 畅销书《三体》作者刘慈欣,果壳网、在行创始人姬十三,中国科学院大学人文学院科学传播教授李大光,“社会生物学之父”爱德华·威尔逊,奇点大学校长 《人工智能的未来》作者,雷·库兹韦尔 畅销书《从0到1》作者彼得·蒂尔联袂推荐。 内容推荐 70年前,诺贝尔物理学奖得主薛定谔提出了著名的“薛定谔之问”——生命是什么。70年后,“人造生命之父”克雷格?文特尔通过合成“人造细胞”的方式给出了完美的解答。 从解码生命、开创全基因组霰弹测序法到合成噬菌体phi X174,从合成完整的基因组,到把一个物种转变为另一个物种,后来到合成人造细胞,文特尔和他的团队完成了一个又一个“不可能完成的任务”,他们在某种意义上,“扮演了上帝的角色”。 假设火星上的生命与地球上的生命都是基于 DNA 的, 假设火星有生命或者曾经有过生命,假设火星上有一 个基因测序设备,可以读取任何有可能存在于那里的“火星人”的 DNA 序列,那么,只需要 4.3 分钟把“火星人” 的基因序列发送回地球,我们就可以在地球上的实验室里重造“火星人”!生命的未来值得我们每一个人期待,不是吗? 克雷格·文特尔著的《生命的未来(从双螺旋到合成生命)(精)》是一本详细论述生命科学的基本原理的杰出著作,全景展示了分子生物学的历史沿革和未来发展方向。 目录 前言 我的“薛定谔演讲” 引言 合成生命时代向我们走来 第一部分 生命是什么 01 “合成生命”是可能的吗 合成尿素,一个对神秘生命力说“不”的故事 形形色色的“活力论” 冯·诺依曼的“细胞自动机” 合成生命时代的到来 02 数字生命的曙光 遗传物质:蛋白质,还是 分子生物学的兴起 蛋白质:生命的硬件 布朗运动:生命的驱动力 第二部分 生命的合成 03 解码生命,从基因测序开始 桑格测序法 全基因组霰弹测序法 最小基因集 新挑战:完整基因组的合成 04 噬菌体phi X174的合成 科恩伯格,探索生命奥秘的先锋 精度,合成基因组的关键 大功告成:第一个合成传染性病毒 phi X174 诞生 伦理问题 05 第一个基因组的合成 目标:合成 582 970 个碱基对 准备高精度的 DNA 序列数据 合成基因组的组装 重大突破:第一个合成支原体诞生 06 把一个物种转变为另一个物种 历史上的细胞核移植 基因组移植:从丝状支原体到山羊支原体 蓝色菌落,移植成功的重要标志 “不可能完成的任务”:改变物种 07 第一个人造细胞的诞生 无法绕过的两个难题 甲基化,合成基因组移植的关键 生死之间:一个碱基对的对错 奇迹出现:第一个有生命的合成细胞 第三部分 生命的未来 08 “合成生命”究竟意味着什么 什么叫“合成生命” 有个“通用受体细胞”就好了 新探索:细胞间的合作 09 设计生命 生命的计算机建模 iGEM 大赛 安全与伦理 10 造福人类的“生命瞬间转移” 瞬间转移,人类永恒的梦想 快速提供疫苗 快速提供噬菌体 结语 只需4.3分钟传回基因信息,我们就能重造火星人/ 译者后记 试读章节 然而,与历史上一再经受重新考察的许多重大发现一样,维勒所完成的贡献也经历了一个重新解释的过程。“修正后的故事”带给我们的新见解甚至可能会使那些接受传统教科书解释的人感到惊讶——科学史学家彼得·兰贝格把这种传统解释称为“维勒神话”。这个神话在1937年达到顶峰,伯纳德·贾菲在他所著的一本相当受欢迎的化学史著作《严酷的考验:伟大的化学家的生活和成就》中,细致生动地描写了维勒作为一个年轻的科学家在他那“神圣的庙宇”(实验室)中“辛苦劳作”,最终证伪了神秘生命力量的故事。 兰贝格指出,维勒做出的贡献当然是实验研究历史上的一个里程碑,这一点是毫无疑问的。然而,令人奇怪的是,维勒同时代的人对这一结果的反应究竟如何,为什么留下来的记录少到几乎没有。尽管贝采里乌斯显然对维勒的工作激动不已,但是这与其说是在活力论盛行的时代背景下的一种反应,还不如说是因为尿素的合成标志着可以把盐类化合物转变为非盐类物质。维勒证明,只要通过重新排列内部原子,就能够把氰酸铵变成尿素,而重量上既不增也不减,这也就意味着,他已经给出了被化学家称为“异构现象”的最重要的、最好的一个例子。维勒的做法无疑有助于破除原来的陈旧观念,即具有不同的物理和化学性质的两个物体不能由同样的成分构成。 历史学家现在普遍认为,仅凭一个实验不足以证明维勒发现了有机化学这个领域。维勒的尿素合成似乎并没有对活力论造成什么实质性的影响。贝采里乌斯本人认为,尿素只不过是一种废料:与其说尿素是一种有机化学物质,还不如说它“占领”了有机和无机之间的“中间地带”。此外,维勒的原料本身就来自有机物,而不是来自无机物。而且他这个成果也并非是独一无二的:早在四年前,他自己就已经利用水和氰人工制成了另一种有机化合物:草酸。科学史学家约翰·布鲁克(John。Brooke)的最后结论是,维勒的合成尿素“只不过是试图阻碍活力论思想的河流滚滚向前的一小块儿鹅卵石而尸”。 活力论就像宗教一样,并不会随着新的科学发现不断涌现而轻易地自行消失。要实现信仰体系的更新换代,就必须从大量的实验中积累起足够厚实的证据。尽管不断进步的科学已经渐渐促使人们摆脱活力论的影响,但是这需要人们付出几百年的努力,甚至到了今天,扑灭这种神秘主义信仰的任务仍然没有最终完成。 . 回顾历史,我们发现,如果能够有效地利用一系列关键成果,古老的活力论思想原本早该被摧毁了。这最早可以追溯到1665年,当时罗伯特.胡克(Robert Hooke,1 635—1’703)开创性地使用了显微镜,有史以来第一次发现了细胞。由于胡克以及其他一些发明家的努力,如荷兰人安东尼·范.列文虎克(Antonie van Leeuwenhoek,1632—1723),科学家们积累了许多“细胞演化为生命的主要生理结构”的证据。在16世纪和17世纪,随着现代科学的诞生,活力论面临着更为严峻的挑战。到了1839年,即维勒合成尿素十多年后,马蒂亚斯·雅各布·施菜登(Matthias Jakob Schleiden,1804-1881)和西奥多·施旺(Yheodor Schwann,1810—1882)已经明确地写道:“所有活的生物都是由活的细胞构成的。”1855年,现代病理学之父鲁道夫。菲尔绍(RudolfVirchow,1821一1902)提出了所谓的生物发生法则(Biogenic Iraw),即“一切细胞皆来源于细胞”或者“所有活细胞都来自已有的细胞”。这与自然发生说的观点形成了鲜明的对照。自然发生说可追溯到古罗马时期,顾名思义,这种学说认为,生命能够从非生命的物质中自发地产生,比如说,蛆虫生自腐烂的肉、果蝇产自香蕉。 1859年,路易·巴斯德(Louis Pasteur,1822—1895)完成了一个著名的实验,有力地反驳了通过简单的实验就能实现“自然发生”的观点。巴斯德分别对装在两个不同的瓶子里的肉汁进行了加热,一个是没有塞子的直颈瓶,让肉汁直接接触空气,另一个则是s型曲颈瓶,并且塞上了棉塞。当直接暴露在空气中的直颈瓶里的肉汁冷却后,里面长出了细菌,而在另一个塞了棉塞的曲颈瓶里却没有长出细菌。巴斯德认为,他自己这个实验足以证明微生物无处不在(包括存在于空气中)。然而,与维勒的实验一样,巴斯德的这个实验的具体细节无法让人确信不疑,因为许多明确的证据都是由一系列德国科学家的后续工作提供的。P22-24 序言 我的“薛定谔演讲” 2012年7月12日,我应圣三一学院的邀请到都柏林发表演讲,这次演讲时值著名物理学家、诺贝尔奖得主薛定谔初次发表他的《生命是什么》系列演讲整整70年之后。主办者要求我再次论述薛定谔当初提出的伟大主题,并且希望我在现代科学的基础上,就有关“生命的定义”这一深奥的问题提 出新的洞见和答案。显而易见,对于这个问题,几乎每个人都非常有兴趣,个中原因可谓不言自明。我本人也不例外,不过我还有一些个人的原因。我 年轻时曾在越南当过医护兵,在那个时候,我无比惊异地发现,“有生命的”与“无生命的”两者之间的区别竟是如此的微妙:一张小小的纸巾就能把活着的、有呼吸的人与死人区分出来;甚至在良好的医疗护理下,存活下去的可能性也仍然部分依赖于病人积极向上的思想和乐观开朗的心态。这就证明,高度的复杂性源于活细胞的组合。 在一个美好的星期四晚上,时间是下午4 :30,得益于数十年来分子生物学的发展,我终于走上了薛定谔曾经站过的那个讲台。像他一样,我也是在爱尔兰总统面前发表演讲的。唯一不同的是,现在这个礼堂已经成了圣三一学院的考试大厅,但是讲台仍然是那个无与伦比的讲台。在巨大的枝形吊灯的照射下,站在威廉 · 莫利纽兹(William Molyneux)和乔纳森· 斯威夫特(Jonathan Swift)等人的肖像画下面,我注视着讲台下400位听众,所有人的脸上都浮现出翘首以待的表情;数不尽的式样各异的摄像机闪耀着令人眩目的亮光。当然,我还知道,与薛定谔当初发表演讲时不一样的是,我这 个演讲将会被录音、被现场实况转播、被写进博客,还将会在Twitter上被大量推送,尽管我所要回答的问题,就是我的前辈们已经付出过许多努力试图给出答案的那同一个问题。 在演讲开始后的60分钟时间里,我向听众详细地解释了DNA是如何驱动生物机器运行并最终组成生命的。所有活的细胞都在运行着DNA这个“软件”,它指挥着成千上万个“蛋白质机器人”。自从我们人类第一次搞清楚如何通过对DNA进行排序来解读这个“生命的软件”以来,我们对生命进行数字化操作的历史已经有几十年了。现在,我们可以从计算机数字代码出发,走到另一个方向,即我们能够设计出一种新的生命形式,用化学的方法合成它的DNA,然后用它来“生产制造”出实实在在的生命有机体。这是因为, 我们现在可以对所有的信息进行数字化处理,并且能够将它们以光的速度发 送到任何地方,并且最终能够重组 DNA,再造生命。坐在爱尔兰总统达 ·肯尼(Enda Kenny)旁边的是詹姆斯· 沃森 ,沃森一直自称是我的老牌竞争对手。在我的演讲结束之后,沃森走上讲台,握着我的手,大方地祝贺我发表了“一个非常美妙的演讲”。 《生命的未来》这本书的部分内容就是在圣三一学院演讲的基础上写成的。本书的宗旨是,将我们现在已经取得的令人难以置信的进展描述清楚。自薛定谔发表《生命是什么》系列演讲到现在,才过了70多年,说起来这只不过相当于一个人的生命周期。但是在这段时间里,我们确实已经取得了极大的进展。从薛定谔的“非周期性晶体”(aperiodic crystal)到对遗传密码的正 确理解,再到第一个合成染色体的成功构造,又到制造出第一个人造细胞,从而最终证明DNA就是生命的“软件”,这些伟大成就是建立在过去半个多 世纪以来的各项巨大进展的基础之上的,也是来自世界各地的许多杰出科学家在各自的实验室里不断努力的共同成果。在本书中,我将对分子和合成生物学领域中的进展进行一个综述,一方面是对这个史诗般的事业和成就的致敬,另一方面是对那些为这个伟大事业 做出杰出贡献的无数重要科学家的致谢。当然,我的目的并不是对合成生物学的发展历史做一个全面、完整的描述,而是希望借此阐明,被我们称为“科学”的这项事业,它的力量固然无比巨大,但是它也极其需要所有人齐心协力进行合作。 现在,作为数字化信息的DNA不仅能够在计算机数据库中实现不断的 积累,而且能够通过生物传送器以一种电磁波的 形式以光速或者接近光速进行传输,从而在一个遥远的地方重新创造出蛋白质、病毒和活的细胞,或许这将永远地改变我们对生命的看法。随着这个对生命的全新理解以及我们驾驭生命的能力的逐步扩展,我们有力地敲开了一扇全新的蕴含着无限可能性的大门。这是极其激动人心的。 随着工业化时代接近尾声,我们有幸见证了“生物设计时代”的来临。人类即将进入一个全新的演化阶段。 后记 我在翻译《富足》一书的时候,克雷格·文特尔就给我留下了深刻的印象。现在,《生命的未来》一书终于译完,对文特尔这个奇人、对他的异事,我都有了更深入的了解。 尽管我对生物学界的情况不太了解,但是我还是愿意大胆地猜测一下:文特尔或许是全世界最乐观的生物学家了吧。在本书中,文特尔指出,数字生命时代正在向我们走来j计算机科学与合成生物学的结合,将彻底改变我们这个星球的面貌。不久之后,我们设计出来的细胞和有机体,就能够制造出生物燃料、分解污染物质、生产全新的药物,甚至在地球上重建外星球的生命形式(假设人类能得到外星人的DNA序列),或者以光速将人类送到外星球上。 文特尔给我打开了一片新天地,让我时时欢喜赞叹!在翻译过程中,我忍不住经常向身边的人转述书中描述的种种奇妙之处。影响所及,连我刚上小学二年级的儿子贾岚晴也整天“蛋白质、氨基酸、DNA”不离口。儿子对这本书充满了期待。其实,我已经翻译过很多本书了,只有这一本,他郑重其事地对我说:“爸爸,出版后,你可要签好名,送我一本!,,这确实是从来没有过的最美妙体验。 因此在这里,请允许我把这本书献给我的儿子贾岚晴。托戴曼迪斯、文特尔等人的福,我现在已经敢于相信,待他长大时,世界应该已经变得更加美好了。 感谢我的妻子傅瑞蓉给我的帮助。她是我所有作品的第一位读者和批评者,总是可以帮助我做出很多改进。感谢儿子贾岚晴,他的成长和进步是我最大的快乐。感谢岳父傅美峰、岳母蒋仁娟两位老人对我儿子的悉心照料。 感谢湛庐文化的策划编辑简学老师对我的信任和帮助。 感谢汪丁丁教授、叶航教授和罗卫东教授的教诲。感谢何永勤、虞伟华、余仲望、鲍玮玮、傅晓燕、傅锐飞、陈叶烽、李欢、傅旭飞、丁玫、何志星、陈贞芳、楼霞、郑文英、商瑜、李晓玲等好友的帮助。 我任职的机构以“跨学科研究中心”为名,我自己也从来不惧惮进入全新的学科领域学习、探索,但是翻译《生命的未来》的经历,仍然算得上是一次智识冒险。这一次,我真的是边学习边翻译的。尽管我如履薄冰,自问已经尽了最大努力,但仍然担心辜负了文特尔这本好书。因此,特别需要专家和读者的批评指正! 书评(媒体评论) 克雷格·文特尔(J Craig Venter),发明了先进的“霰弹测序法”,创造了真正合成意义的人造生命。从人类基因组测序的先驱之一,到合成生命,在他那一系列几乎令人眼花缭乱有些甚至是跨领域的不懈探索和巨大成就中,领军其中任何一项就是了不起的科学家了。他一次次特立独行的壮举让他有了“测序狂人”“科学狂人”的雅号。《生命的未来》这本书又把我们引至激动人心的合成生物学前沿。 ——曾长青 中国科学院北京基因组研究所研究员 中国科学院精准基因组医学重点实验室主任 薛定谔的《生命是什么》影响了一代又一代生物学家,并开启了生物学新时代。克雷格·文特尔追随薛定谔的脚步,在破译生命密码方面更进一步,他创造的“人造细胞”震惊了世界!我希望,对生命奥秘的探索,既能造福人类,又能帮助我们探知无边的宇宙。 ——刘慈欣 著名科幻小说作家 畅销书《三体》作者 孩子都会拆闹钟,但只有能拼回去的时候才算真正理解了它的运作原理。人类拆开生命已经有漫长的历史,但文特尔也许将是把它拼回去的人! ——姬十三 果壳网、在行创始人 初次“结识”克雷格·文特尔是在大约10年前的法国戴高乐机场。《时代周刊》的封面人物似乎在对视着上帝,标题是《玩弄上帝?》。从那时起,我开始追踪这个争议大、也是具有传奇色彩的科学家 ,他的新书《生命的未来》详细论述了生命科学的基本原理,更重要的是,读者可以了解当今科学跨学科的融合:物理、化学、生物学以及天文学之间密不可分的关系。看完后,你一定会想:如果文特尔有一天获得诺贝尔奖,会是哪个领域的呢? ——李大光 中国科学院大学人文学院科学传播教授 国际科学素养促进中心中国研究中心主任 克雷格·文特尔是一位出类拔萃的科学家,他的《生命的未来》不但清晰地勾画了分子生物学的发展史,也展示了他和他的团队在 “合成生命”领域的卓越成就。这是继詹姆斯·沃森的《双螺旋》之后,生物学领域的又一部杰作! ——爱德华·威尔逊 哈佛大学教授, “社会生物学”之父 “普利策奖”获奖图书《论人性》《蚂蚁》作者 人类正在经历一个重大转折点,因为克雷格·文特尔根据计算机设计的合成DNA创造出了新生命!《生命的未来》这本书讲述的就是“奇点”到来之时DNA信息和计算机如何有机结合的有趣故事,不但震撼力十足,也极具说服力。人类进化一旦经过“奇点”,生命、社会以及我们关心的一切,都可能有令人震惊的事情发生。 ——雷·库兹韦尔 奇点大学校长, 谷歌公司工程总监 《人工智能的未来》《奇点临近》作者 下一次科技产业革命将发生在生命科学领域。 ——彼得·蒂尔 畅销书《从0到1》作者 |