《内经评文灵枢》部分共十二卷，以圈点、夹批、旁批和总批方式，对全文作了评点。评点重在分析篇章结构、文法笔势，使得纲领得挈，要害显明：并加以注音释字，阐发医理，旁及《黄帝内经灵枢注证发微》《类经》等书，使幽微自明；间杂以校正文字错简，参之《甲乙经》，颇有精到之处。加之刻版又清晰明朗，成为精校善本。任应秋先生认为本书是《内经》学习的较好选本。其优点有二：一是每篇文字分做若干节段，读起来易于理解；二是校刊较好，错误很少，断句亦较正确。
本次整理原书为繁体竖排，今改为简体横排。文中表示文字方位的词“左”“右”，亦相应改为“上”，“下”。除涉及周氏注文的个别用字仍使用底本原字外，异体字、古今字、俗字、避讳字，一并径改为通行简体字，不出校记。
底本中使用原有其字的通假字，若见于《灵枢经》原文中，一般不予处理；若见于周学海评文中，则征引书证说明通假关系。