宁永忠、李明、严岩编著的《感染性疾病的微生物学》侧重于非靶向检查。靶向检查指临床指定检查某菌种（专用选择培养基分离、种特异性抗原抗体检查、种特异性核酸检查）。靶向检查的参考书籍和资料非常丰富，可以说绝大多数教材和专业书籍都是以菌种为中心或以抗原、核酸为中心进行叙述的。而实际工作中的难点在非靶向检查（临床没有指定分离对象，实验室用标准培养基等检测），此时结果的不确定性较大。

宁永忠、李明、严岩编著的《感染性疾病的微生物学》作者立足于感染性疾病学和临床微生物学国际知识，同时又能够结合各自所在医院的实际工作经验，因此该书的学术水平和应用价值都值得重视。《感染性疾病的微生物学》立足于国际指南、英国健康保护署HPA的标准化操作规程、美国临床微生物学操作手册CMPH、美国国家医学图书馆公共医学文献数据库pubmed中的杂志文献等，同时又结合了国内可信文献内容，起点较高。就实用而言，该书的价值有两点：一是构建了临床医学、临床微生物学、感染控制学等学科的对话平台，按时间顺序和逻辑顺序依次列出各自理念行为，使人一目了然；二是为一线临床微生物学工作提供了一个很好的工作参照，既包括分析中的工作，也包括分析前、分析后的内容。

1血行感染和菌血症

2血管内插管相关性感染

3其他血管相关性感染

4感染性心内膜炎

5心包炎

6心肌炎和纵隔炎

7咽喉部感染

8鼻窦炎

9耳炎和乳突炎

10肺炎

11其他下呼吸道感染

12胸膜炎和胸腔积液

13尿路感染和无症状菌尿

14性传播疾病 感染

15男性生殖道感染

16女性生殖道感染

17羊膜炎

18乳房感染

19口腔感染

20感染性腹泻

21细菌性食物中毒

22其他消化道感染

23腹腔内感染

24腹膜透析感染

25胆囊炎和胆管炎

26细菌性 真菌性脑膜炎、脑脓肿

27眼部感染

28关节炎

29骨髓炎

30皮肤软组织感染

31手术切口感染和手术后感染

32肌炎

33烧伤

34糖尿病足感染

35浅部真菌

36脓肿

37深部感染时的活检和组织标本

38淋巴结炎和淋巴管炎

39发热和脓毒症

40新生儿感染

41特殊人群感染