崔世友、孙明法编著的《分子标记辅助选择导论》是一本能让普通育种家看得懂的介绍MAS方面的知识的书籍。全书共分八章，具体内容包括：遗传标记、连锁图谱的构建、质量性状的分子标记、数量性状的分子标记、关联作图、分子标记辅助选择、作物育种目标性状的标记辅助选择、标记辅助选择研究和育种应用展望。

第一章 遗传标记

 第一节 遗传标记的概念

 第二节 基于DNA杂交的DNA标记

 第三节 基于PCR的DNA标记

 第四节 基于限制性酶切和PCR的DNA标记

 第五节 基于单核苷酸多态性的DNA标记

第二章 连锁图谱的构建

 第一节 图谱构建的理论基础

 第二节 作图群体

 第三节 标记的多态性鉴定与数据处理

 第四节 标记的连锁分析

第三章 质量性状的分子标记

 第一节 近等基因系分析法

 第二节 分离体分组混合分析法

第四章 数量性状的分子标记

 第一节 为何要寻找QTL？

 第二节 数量性状位点的初级定位

 第三节 数量性状基因的精细定位

第五章 关联作图

 第一节 连锁不平衡

 第二节 连锁作图和连锁不平衡作图比较

 第三节 关联分析的步骤、策略和基本方法

 第四节 嵌套关联作图：QTL定位的新发展

 第五节 关联分析的应用

第六章 分子标记辅助选择

 第一节 标记辅助选择概述

 第二节 标记辅助选择中标记的开发

 第三节 标记辅助选择在作物育种中的应用

 第四节 MAS用于改良质量性状

 第五节 MAS改良数量性状

 第六节 影响分子标记辅助选择的因素

第七章 作物育种目标性状的标记辅助选择

 第一节 产量MAS

 第二节 抗病虫性MAS

 第三节 耐逆性MAS

 第四节 品质性状MAS

第八章 标记辅助选择展望

 第一节 标记辅助选择影响低的原因

 第二节 功能性分子标记的开发与应用

 第三节 从高代回交QTL分析到分子设计育种

主要参考文献