《藏象异论》面世至今有两个年头了，这段时间不算太长，但对它的认识愈加觉得肤浅，故有必要予以重新修订，于是就有了现在李文专著的《藏象异论（第2版）》。与第一版相比，它有如下特点：
第一，继续坚持“物本论”的认识，并讨论精气学说和元氟论。此外，尝试重新规定精气、元氟的含义。
第二，讨论传统中医所涉及的有关细胞分子生物学、解剖学、生理学的原始内容，目的是将这些内容从传统的中医体系中分离出来，以避免与藏象学说相混。
第三，继续坚持五行藏象与二对阴阳藏象的认识，并对阴阳藏象有所调整，即将“风”（代替气）引入之后，形成“风血水火精神”之新三对阴阳藏象。另外，进一步强化“风血水火精神”不是指事物的具体形态概念，而是超越有形无形的一种物质模型概念。对于前者则以中医精气一细胞分子生物学、中医解剖学、中医生理学中的精气、血津液、脏体官窍等概念替代，同时合理地引入现代医学的有关认识，完善这些学科体系，为中医整体现代化打下基础。
第四，正式将“胃”从传统所谓的“腑”系中抽出，并提升到“藏”的地位，即形成“心肺脾胃肝肾”六大五行藏象系统。