2009年，山东社科院为适应由学术研究机构向智库机构转型的需要，成立了省情综合研究中心，主要是承担山东省经济社会发展中的重大课题和省委省政府领导交办的课题。

秦庆武编著的《三农问题——危机与破解》设有论文篇、研究报告篇、访谈与建设三个篇章，探讨了中国三农问题的困境与出路、农业产业化与农业产业组织的创新等问题。

论文篇

中国三农问题的困境与出路

农民负担：应实现从“减轻”到“取消”的转变

农业产业化与农业产业组织的创新

农业产业化与农村合作制结合研究

加快我国农村新型合作经济组织的发展

关于土地征占用中农民权益保护的几个问题

调整城乡关系是增加农民收入的根本出路

从城乡互动、城乡融合到城乡一体

全面贯彻落实科学发展观加快山东新农村建设步伐

村企互动：新农村建设的成功探索

统筹城市化发展与新农村建设

加入WTO对我省粮食生产的影响与对策

农村经营体制创新与农民增收

农村信用社小额信贷与降低贫困的实证分析

推进山东农村的第二步改革

走中国特色的农业现代化道路

山东农村改革30年回顾与前瞻

山东推进城乡一体化的实践与探索

适应农业经营方式变化推进农业管理体制改革

 ——基于山东农业发展的调查与思考

研究报告篇

统筹城乡经济社会发展与增加农村公共产品供给研究

加快农产品加工业发展的途径和对策研究

农村税费改革与山东县乡财政体制调整研究

实施农业产业化、国际化、城镇化战略破解“三农”难题研究

山东省县域经济发展战略研究

山东省农业和农村经济发展环境条件分析与预测

山东省推进农村富余劳动力就地就近转移研究

访谈与建议篇

统筹城乡 破解“三农”

 ——山东社会科学院农村经济研究所所长秦庆武教授一席谈

农村半数劳力不务农意味着什么

 ——访山东社会科学院农村经济研究所所长秦庆武教授

县乡财政的困境与出路

 ——访山东社会科学院农村经济研究所所长秦庆武教授

关于在我省实施“新乡村建设”工程的建议

关于在我省实施社会主义新农村建设“千村示范”行动的建议

尽快统筹解决农村教师工资问题

关于政府购买公共服务岗位支持新农村建设的建议

一产三产化：现代都市农业发展的趋势

关于把推进城乡一体化作为我省拉动内需新增长点的建议

推进城市化进程中的问题与建议

 ——我国城市化进程的观察与思考

推进城乡一体化的有效探索

 ——平原县实施“初中进城”工程的做法与启示

关于解决失业农民工就业问题的十条建议

加快推进现代农业建设

撤村建社区的“诸城模式”及启示

迁村并居不宜刮风

打好新十年山东农村扶贫工作的攻坚战